More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1620 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 567 aa  1164    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  53.37 
 
 		 564 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  53.01 
 
 		 561 aa  581  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.23 
 
 		 572 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  51.9 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  52.41 
 
 		 568 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  51.07 
 
 		 575 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  51.45 
 
 		 548 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  51.16 
 
 		 574 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  49.55 
 
 		 566 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  51.6 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  53.07 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  50.9 
 
 		 572 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  51.18 
 
 		 549 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  50.45 
 
 		 550 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  52.42 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  52.71 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  52.89 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  51.52 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  49.65 
 
 		 570 aa  532  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  52.24 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  52.24 
 
 		 567 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  51.15 
 
 		 581 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  49.26 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  49.01 
 
 		 555 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  52.71 
 
 		 567 aa  525  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  50.36 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  49.1 
 
 		 552 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  50.97 
 
 		 556 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  51.37 
 
 		 553 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  50.98 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  49.91 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  49.19 
 
 		 572 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  50.18 
 
 		 564 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  48.39 
 
 		 558 aa  504  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  49.29 
 
 		 559 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  49.12 
 
 		 565 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  48.85 
 
 		 557 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  48.76 
 
 		 565 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  47.93 
 
 		 559 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  49.28 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  48.37 
 
 		 582 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  49.64 
 
 		 567 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 580 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  46.82 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  49.46 
 
 		 566 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.49 
 
 		 559 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  46.55 
 
 		 576 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  48.21 
 
 		 558 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  48.75 
 
 		 558 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 		 561 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  47.15 
 
 		 567 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  46.05 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  44.44 
 
 		 538 aa  461  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.94 
 
 		 572 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  45.58 
 
 		 568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  38.92 
 
 		 552 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  40.11 
 
 		 551 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  37.29 
 
 		 583 aa  329  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  36.43 
 
 		 551 aa  326  7e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  37.45 
 
 		 543 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  38.3 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.17 
 
 		 560 aa  301  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  36.64 
 
 		 586 aa  292  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  35.94 
 
 		 587 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.89 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.96 
 
 		 576 aa  259  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.31 
 
 		 567 aa  248  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  29.82 
 
 		 542 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.67 
 
 		 573 aa  247  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.23 
 
 		 569 aa  246  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.91 
 
 		 573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.3 
 
 		 566 aa  243  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.07 
 
 		 548 aa  243  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2862  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.23 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.09 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.44 
 
 		 573 aa  241  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.18 
 
 		 552 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  30.27 
 
 		 589 aa  240  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  30.27 
 
 		 589 aa  240  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.55 
 
 		 599 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 		 574 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  29.84 
 
 		 566 aa  239  9e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  31.77 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.04 
 
 		 579 aa  238  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.13 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.36 
 
 		 570 aa  237  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.21 
 
 		 608 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.4 
 
 		 575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.4 
 
 		 575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>