66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1595 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  64.4 
 
 		 191 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  38.51 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  31.67 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  29.09 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  29.19 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  29.57 
 
 		 174 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  30.59 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  26.6 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  30.12 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  29.35 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  29.94 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  28.49 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3639  lipoprotein  28.71 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  29.26 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  25.82 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  30.22 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  27.01 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  26.55 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  26.52 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  26.52 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3472  hypothetical protein  23.78 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000238843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  25.97 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  25.7 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  25.7 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  25.97 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  25.7 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25.97 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  25.7 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  24.16 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  20.97 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  23.81 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  25.67 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  25.13 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  25.13 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  27.33 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  24.06 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  24.6 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  25.41 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  23.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  25.29 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3234  putative lipoprotein  24.73 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.104755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  25.53 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  26.4 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  20.65 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  26.04 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  24.57 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  25.15 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1577  hypothetical protein  23.04 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  25.44 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  25.14 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  27.12 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1735  hypothetical protein  30.59 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.428969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  25.27 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  24.59 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  23.67 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 183 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>