42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1427 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  886    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190299  hitchhiker  0.00191457 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1887  hypothetical protein  73.87 
 
 		 442 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00257246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1335  ZipA FtsZ-binding region  58.06 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1271  ZipA FtsZ-binding region  57.83 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1397  hypothetical protein  55.89 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5335  hypothetical protein  48.46 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1927  ZipA FtsZ-binding region  46.89 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.160599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1675  hypothetical protein  46.98 
 
 		 430 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109275  normal  0.0264473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2020  hypothetical protein  47.89 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2045  ZipA FtsZ-binding region  48.13 
 
 		 427 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6052  hypothetical protein  48.67 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2025  hypothetical protein  48.67 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2462  ZipA FtsZ-binding region  47.77 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00887227  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1345  ZipA FtsZ-binding region  47.38 
 
 		 411 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149223  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1251  ZipA FtsZ-binding region  48.68 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2058  hypothetical protein  45.75 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2444  hypothetical protein  46.89 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2590  hypothetical protein  46.67 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1335  hypothetical protein  46.14 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3248  hypothetical protein  46.14 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2063  hypothetical protein  46.14 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1562  hypothetical protein  46.14 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2501  hypothetical protein  46.67 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2951  ZipA FtsZ-binding region  40.54 
 
 		 367 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1811  hypothetical protein  43.01 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2593  hypothetical protein  38.24 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592604  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2842  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  41.18 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1815  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  39.13 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2200  hypothetical protein  39.78 
 
 		 350 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.718761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2085  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  39.71 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.300257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1670  ZipA FtsZ-binding region  39.71 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3591  ZipA  34.35 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0210029  normal  0.0561961 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4464  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  38.69 
 
 		 354 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549728  normal  0.824523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2513  ZipA FtsZ-binding region  38.24 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604929 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0502  ZipA FtsZ-binding region  35.56 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1456  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  34.15 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1733  ZipA-like protein  28.95 
 
 		 421 aa  139  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0528792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2191  ZipA FtsZ-binding region  28.11 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0623  hypothetical protein  31.3 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0646  ZipA, C-terminal FtsZ-binding region  29.03 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1402  ZipA-like protein  25.27 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.387913  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.34 
 
 		 2449 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>