More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1362 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  81.22 
 
 		 427 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  84.77 
 
 		 394 aa  683    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  81.73 
 
 		 394 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  81.47 
 
 		 394 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  93.65 
 
 		 394 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  81.22 
 
 		 394 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  81.73 
 
 		 427 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  81.47 
 
 		 394 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  80.96 
 
 		 394 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  86.8 
 
 		 394 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  81.73 
 
 		 394 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  100 
 
 		 394 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  81.73 
 
 		 394 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  82.23 
 
 		 394 aa  664    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  86.55 
 
 		 394 aa  705    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  81.47 
 
 		 427 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  80.05 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  79.39 
 
 		 397 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  78.93 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  79.39 
 
 		 397 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  78.43 
 
 		 394 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  78.88 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  79.13 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  78.17 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  78.17 
 
 		 394 aa  607  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  77.16 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  78.63 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  77.86 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  77.61 
 
 		 409 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  75.89 
 
 		 395 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  76.65 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  67.01 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 		 396 aa  534  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  71.32 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  67.86 
 
 		 395 aa  530  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  65.9 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  66.92 
 
 		 398 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  67.6 
 
 		 394 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  65.98 
 
 		 392 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  67.86 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  67.09 
 
 		 396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  67.09 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  68.11 
 
 		 395 aa  511  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  63.94 
 
 		 394 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  61.64 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  63.94 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  65.47 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  62.76 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  64.96 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  63.68 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  59.9 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  60.1 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  61.64 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  59.59 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  59.34 
 
 		 391 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  57.11 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  60.77 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  57.25 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  60.1 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  59.18 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  56.63 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  59.59 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  59.34 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.92 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  53.4 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 		 392 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.13 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.63 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 		 394 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>