More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1268 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  98.12 
 
 		 372 aa  721    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  96.51 
 
 		 372 aa  710    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  100 
 
 		 372 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3708  ABC-2 type transporter  78.38 
 
 		 374 aa  554  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  50.54 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  50.27 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  49.73 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 		 370 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  49.18 
 
 		 370 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  44.96 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  44.38 
 
 		 356 aa  315  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  43.44 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  41.8 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  41.53 
 
 		 368 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  41.53 
 
 		 368 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  41.53 
 
 		 368 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  41.53 
 
 		 368 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  41.87 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  41.8 
 
 		 368 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  42.02 
 
 		 368 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  41.94 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  41.99 
 
 		 384 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  40.98 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  42.05 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  41.78 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  42.51 
 
 		 368 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  41.8 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  41.8 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  40.76 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  41.21 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  41.31 
 
 		 373 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0262  ABC-type multidrug transport system permease component  42.15 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  40.22 
 
 		 374 aa  259  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  40.22 
 
 		 372 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2393  ABC-2 type transporter  40.87 
 
 		 369 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2155  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 435 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  41.12 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  39.94 
 
 		 376 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  40.66 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  35.37 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  39.13 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  35.77 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  37.85 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  36.83 
 
 		 376 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  35.1 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  36.83 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  38.42 
 
 		 375 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  37.77 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  36.02 
 
 		 377 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  37.64 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 376 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  35.5 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  35.15 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  34.7 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 		 364 aa  202  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  39.71 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  33.15 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0348  ABC-type multidrug transport system permease component  31.27 
 
 		 346 aa  199  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  34.69 
 
 		 379 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  33.88 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  34.05 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  36.34 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  34.75 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  30.91 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 		 378 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  33.24 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 378 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  34.73 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  32.55 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  29.43 
 
 		 369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  34.71 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 376 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 377 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  32.43 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 378 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  30.95 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 		 383 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>