More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1209 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  93.18 
 
 		 264 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  90.15 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  90.53 
 
 		 264 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  473  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  473  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  89.77 
 
 		 264 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  473  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  87.88 
 
 		 264 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  88.26 
 
 		 264 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  81.06 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  79.92 
 
 		 264 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  79.92 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  79.17 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  79.17 
 
 		 264 aa  424  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  80.61 
 
 		 264 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  78.41 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  81.06 
 
 		 264 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  81.06 
 
 		 264 aa  410  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  76.14 
 
 		 264 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  75.76 
 
 		 264 aa  397  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  73.76 
 
 		 264 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  73 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  73.38 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  66.29 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  61.74 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  61.36 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  65.53 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  61.22 
 
 		 264 aa  328  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  60.61 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  58.65 
 
 		 267 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  62.86 
 
 		 245 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  62.36 
 
 		 264 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  58.56 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  59.32 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  56.6 
 
 		 265 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  54.37 
 
 		 264 aa  285  5e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.95 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  51.91 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  50.57 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  49.43 
 
 		 267 aa  268  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  50.57 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  49.81 
 
 		 267 aa  265  7e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  53.23 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  47.15 
 
 		 264 aa  261  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  49.81 
 
 		 265 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.53 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  50.57 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  50.57 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49.6 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  46.39 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 265 aa  248  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  43.35 
 
 		 265 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  50.76 
 
 		 263 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  49.81 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  47.98 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  41.34 
 
 		 257 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42.17 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  40.4 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 254 aa  202  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 252 aa  202  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.16 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.31 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 		 253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  38.7 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  39.05 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.86 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  30.57 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0846  ABC transporter related  32.27 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409124  normal  0.0400632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  34.45 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.63 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1387  ABC transporter related protein  32.44 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  31.93 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  34.89 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0248  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.68 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1015  ABC transporter related  32.23 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.89 
 
 		 357 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4904  ABC transporter related  34.94 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.73 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  33.07 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  36 
 
 		 356 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.97 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  31.91 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.18 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.18 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.68 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>