More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1168 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  100 
 
 
217 aa  433  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  55.56 
 
 
220 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  54.21 
 
 
221 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  52.58 
 
 
215 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  48.36 
 
 
219 aa  207  8e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  50.99 
 
 
222 aa  191  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  36.15 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  35.85 
 
 
225 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  32.87 
 
 
216 aa  101  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  32.87 
 
 
216 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  33.95 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  33.18 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  32.24 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  30.56 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  32.42 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  36.56 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  33.7 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  27.57 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  32.41 
 
 
222 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  32.56 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  30.84 
 
 
194 aa  89  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  36.77 
 
 
296 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  31.94 
 
 
213 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  33.64 
 
 
209 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
211 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  32.8 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  41.54 
 
 
269 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  28.37 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  32.67 
 
 
211 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  30.14 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  30.41 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.44 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  29.11 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  28.77 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.61 
 
 
196 aa  82  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  34.56 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  29.44 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  33.64 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  30.23 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  32.09 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  32.41 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  31.31 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  31.31 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  29.03 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  28.77 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  30.37 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  30.37 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  30.37 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  30.37 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  30.37 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  36.57 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  29.91 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  29.91 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  31.22 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  26.42 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  32.43 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  31.48 
 
 
205 aa  72  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  38.82 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  29.33 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  28.65 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  30.46 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  33.07 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  24.55 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  32.88 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  31.69 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  28.57 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  26.17 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  24.3 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  26.88 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  27.69 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  26.9 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  30.83 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  31.03 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  22.9 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  28.5 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  27.7 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  28.96 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  32.24 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  36.36 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  32.37 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  32.96 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  26.48 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  27.89 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  24.2 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3119  hexapaptide repeat-containing transferase  27.67 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.022833  hitchhiker  0.00127882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  28.11 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  40.38 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0455  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  31.78 
 
 
571 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  40.38 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  29.45 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  32.8 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  34.93 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  27.33 
 
 
174 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  22.34 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2199  acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  33.98 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0074147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4764  transferase hexapeptide repeat containing protein  54.55 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.935522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.59 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2444  UDP-N-acetylglucosamine acyltransferase  37.97 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00303767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  28.37 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>