293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1151 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  280  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  81.2 
 
 		 133 aa  236  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  61.24 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  62.9 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 		 132 aa  170  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  57.69 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 		 143 aa  165  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  59.69 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  59.68 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  58.46 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  56 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  48.48 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  60.19 
 
 		 213 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  52.34 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  51.18 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  42.19 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  42.97 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  38.76 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  42.28 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  41.46 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  32.23 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  30.88 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.52 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  34.13 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  38.75 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  30.65 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  30.08 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  34.09 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.76 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  34.83 
 
 		 149 aa  57  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  32.28 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  33.71 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.71 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.71 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.71 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  28.79 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>