More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1133 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1133  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.03617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1252  alpha/beta fold hydrolase  83.96 
 
 		 274 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1561  hydrolase protein  68.66 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1662  alpha/beta hydrolase fold protein  69.03 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.665083  normal  0.0127757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  69.03 
 
 		 274 aa  361  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2771  alpha/beta hydrolase fold  60.95 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  58.27 
 
 		 270 aa  304  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  57.2 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1356  Alpha/beta hydrolase fold protein  60.95 
 
 		 277 aa  291  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.965846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3159  alpha/beta hydrolase  53.9 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  52.22 
 
 		 272 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  49.63 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  51.14 
 
 		 260 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1655  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.831884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2049  alpha/beta hydrolase fold protein  50.37 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181769  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  49.25 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  51.52 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4961  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2998  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3781  alpha/beta hydrolase fold  45.29 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  47.73 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1521  alpha/beta hydrolase fold  44.77 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 323 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.29 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.29 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3803  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42 
 
 		 370 aa  62  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.66 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  25.85 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  27.02 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.53 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  36.51 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  27.09 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  26.67 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  28.14 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1204  alpha/beta fold family hydrolase  22.66 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  23.64 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27800  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.65 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.22 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  25.56 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.52 
 
 		 371 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  22.27 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.62 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.67 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1098  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.625731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  24.13 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  22.57 
 
 		 571 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.29 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.29 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1158  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39 
 
 		 371 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0866  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.787606  normal  0.897241 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.2 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>