More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1078 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1115  inositol-1(or 4)-monophosphatase  92.67 
 
 		 274 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  79.55 
 
 		 270 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  79.55 
 
 		 270 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  77.99 
 
 		 270 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  70.45 
 
 		 267 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  69.7 
 
 		 267 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  67.05 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  70.08 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  65.91 
 
 		 284 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1934  inositol-1-monophosphatase  67.53 
 
 		 363 aa  359  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3149  inositol-1-monophosphatase  65.81 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2605  inositol monophosphatase family protein  65.81 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2553  inositol monophosphatase family protein  65.81 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1664  inositol-1-monophosphatase  65.81 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0475156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1441  inositol-1-monophosphatase  65.81 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2168  inositol-1-monophosphatase  65.81 
 
 		 267 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289149  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2689  inositol-1-monophosphatase  65.81 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0179732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  62.88 
 
 		 431 aa  354  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  63.26 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  62.13 
 
 		 273 aa  350  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  62.5 
 
 		 300 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1990  inositol-phosphate phosphatase  66.54 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.410735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2120  inositol monophosphatase  66.54 
 
 		 267 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  60.69 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2104  inositol-phosphate phosphatase  66.54 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5992  inositol monophosphatase  66.54 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2085  inositol monophosphatase  66.54 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5391  inositol-1(or 4)-monophosphatase  65.81 
 
 		 267 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.268577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1196  inositol-phosphate phosphatase  67.05 
 
 		 294 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0278883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3293  inositol-1(or 4)-monophosphatase  64.77 
 
 		 328 aa  333  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  60.31 
 
 		 268 aa  328  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0963  Inositol-phosphate phosphatase  64.02 
 
 		 322 aa  327  9e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.220962  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1380  inositol-phosphate phosphatase  62.5 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135454  hitchhiker  0.00587687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1045  inositol-phosphate phosphatase  64.02 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0806171 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  63.46 
 
 		 268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  63.85 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3566  inositol monophosphatase  61.36 
 
 		 353 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  61.74 
 
 		 297 aa  316  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2070  inositol monophosphatase  61.74 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  60.61 
 
 		 304 aa  315  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  55.17 
 
 		 263 aa  301  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  54.79 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  55.73 
 
 		 266 aa  298  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  57.85 
 
 		 259 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  52.75 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  54.23 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  54.23 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  52.85 
 
 		 267 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  54.37 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  51.67 
 
 		 267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  56.49 
 
 		 270 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  52.85 
 
 		 267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  51.71 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  51.33 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  52.85 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  52.85 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  52.33 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  55.56 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  52.85 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  52.67 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  52.67 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  50.19 
 
 		 267 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  53.41 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  53.03 
 
 		 271 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  51.89 
 
 		 272 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  50.77 
 
 		 266 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  52.27 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  51.14 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  51.89 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  52.27 
 
 		 271 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  51.52 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  51.14 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  50.57 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  51.52 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  50.95 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  51.54 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  50.93 
 
 		 267 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  52.53 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  52.53 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  52.14 
 
 		 267 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  52.14 
 
 		 267 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  52.14 
 
 		 267 aa  264  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  51.75 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  48.68 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  51.75 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  50.77 
 
 		 267 aa  261  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1273  inositol monophosphatase  50.19 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000425107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1165  inositol monophosphatase  50.19 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000142854  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0438  inositol monophosphatase  50.19 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450003  hitchhiker  0.0000301386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>