269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1064 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  100 
 
 
322 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1100  PHP, C-terminal  83.99 
 
 
281 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  69.37 
 
 
286 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  66.55 
 
 
276 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  67.64 
 
 
276 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1683  phosphoesterase, putative  69.82 
 
 
276 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.478385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  69.45 
 
 
276 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  69.82 
 
 
276 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2703  metal-dependent phosphoesterase  70.18 
 
 
276 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  68.31 
 
 
286 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2624  putative phosphoesterase  70.18 
 
 
276 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  70.18 
 
 
279 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  67.61 
 
 
286 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2185  putative phosphoesterase  69.82 
 
 
276 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3132  putative phosphoesterase  69.82 
 
 
276 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  65.45 
 
 
277 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  69.82 
 
 
279 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  69.82 
 
 
279 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  69.82 
 
 
279 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  70.18 
 
 
279 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1901  phosphoesterase, putative  70.91 
 
 
276 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2010  phosphotransferase domain-containing protein  69.45 
 
 
276 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000228692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2137  phosphotransferase domain-containing protein  69.45 
 
 
276 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  65.81 
 
 
298 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  57.91 
 
 
282 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3236  PHP-like  59.45 
 
 
319 aa  345  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  60.07 
 
 
287 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  61.76 
 
 
292 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  61.76 
 
 
292 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  57.35 
 
 
283 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  61.4 
 
 
287 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  60.44 
 
 
287 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4021  PHP domain protein  59.56 
 
 
285 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1626  phosphotransferase domain-containing protein  61.03 
 
 
303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1005  PHP-like  58.99 
 
 
286 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  55.64 
 
 
279 aa  315  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5411  phosphotransferase domain-containing protein  58.46 
 
 
287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.861836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  55.71 
 
 
301 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  53.87 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  54.91 
 
 
287 aa  278  9e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  50.74 
 
 
284 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  49.26 
 
 
278 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  48.16 
 
 
277 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  42.65 
 
 
278 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  45.35 
 
 
286 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  45.35 
 
 
286 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  43.84 
 
 
287 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  47.58 
 
 
282 aa  215  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  43.12 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  43.12 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  42.05 
 
 
298 aa  212  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  47.6 
 
 
284 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  42.65 
 
 
290 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  42.07 
 
 
297 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  43.8 
 
 
299 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  43.8 
 
 
311 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  42.45 
 
 
286 aa  205  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  43.43 
 
 
310 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  41.73 
 
 
302 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  41.73 
 
 
286 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  42.65 
 
 
286 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  43.53 
 
 
286 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  41.73 
 
 
302 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  41.73 
 
 
302 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  43.17 
 
 
286 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  43.17 
 
 
286 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  42.81 
 
 
286 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  42.81 
 
 
286 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  42.8 
 
 
290 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  39.71 
 
 
281 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  43.17 
 
 
286 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  41.61 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  41.91 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  40.14 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  40.14 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  40.14 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  38.81 
 
 
269 aa  200  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  40.14 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  41.61 
 
 
282 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  41.54 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  41.61 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  40.51 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  40.14 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  43.17 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1911  putative phosphoesterase  41.61 
 
 
282 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1425  putative phosphoesterase  41.61 
 
 
282 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.769482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  40.51 
 
 
286 aa  198  9e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  41.67 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  41.91 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  41.91 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  40.37 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  40.14 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  39.78 
 
 
292 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  41.24 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  39.78 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  39.05 
 
 
291 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  40.94 
 
 
286 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  37.87 
 
 
279 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  38.99 
 
 
290 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>