More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1062 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  611  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  81.42 
 
 		 297 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  67.92 
 
 		 305 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  68.38 
 
 		 305 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  67.7 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  65.19 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  65.19 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  65.19 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  64.85 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  65.19 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  65.19 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  64.85 
 
 		 296 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  63.82 
 
 		 296 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  62.46 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  61.43 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  62.12 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  61.43 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  63.48 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  61.09 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  61.09 
 
 		 296 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  61.64 
 
 		 294 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  61.3 
 
 		 294 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  61.38 
 
 		 302 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  53 
 
 		 299 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  52.68 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  51.95 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  53 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  52.49 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  52.96 
 
 		 309 aa  298  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 343 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  51.83 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  52.15 
 
 		 307 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  48.47 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  46.94 
 
 		 289 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 		 339 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  41.05 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  34.45 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.94 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  25.08 
 
 		 282 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28.24 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 288 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.59 
 
 		 2762 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  25.8 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  28.31 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  31.3 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.82 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  24.82 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  32.12 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  24.93 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.52 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  36.94 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  26.26 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 		 462 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  30.41 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  30.99 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.26 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  37.61 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  32.47 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  22.19 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>