More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0983 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0983  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288934  normal  0.0876373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1019  LysR family transcriptional regulator  78.98 
 
 		 297 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5204  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3347  transcriptional regulator, LysR family  47.32 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0221177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3997  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1341  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.281725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2519  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  hitchhiker  0.00756718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0878  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 336 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3156  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5069  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00568872  normal  0.0350365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3949  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1048  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4107  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1757  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074148 
 
 
-
 
NC_004310  BR1086  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3381  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3680  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301341  hitchhiker  0.00043388 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0906  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0116  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734759  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0157  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000802537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2171  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0176  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.175853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1461  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0879  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 314 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24960  LysR family transcriptional regulator protein  42.81 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05850  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2690  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3409  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0550  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5241  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.11151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0783  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5473  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0854  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5573  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3466  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5015  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.95 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46519  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4055  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5664  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3509  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2772  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.500434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5462  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.278821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0174  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1725  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 326 aa  225  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3360  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.91 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5716  transcriptional regulator LysR family  45.05 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0340323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3604  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5160  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.709796 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6757  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.914679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3787  transcriptional regulator, LysR family  43.84 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4430  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.3079  normal  0.432703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4116  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2208  LysR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1251  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0350  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0418  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5641  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1824  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.381841  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1783  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2086  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1113  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.379059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0822  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0444  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5311  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256019  normal  0.0494064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5259  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5169  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0212  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0028482  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4357  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.67748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64910  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5489  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5371  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4782  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.896768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0596  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.73 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4635  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0894  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0117  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1256  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.196796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4920  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5533  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.11 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2377  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2084  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0570  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546598  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0776  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.861314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0499  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1635  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0681  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1987  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58662  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6038  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.904291  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1035  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0665  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0688297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2406  transcriptional regulator, LysR family  41.29 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3007  DNA-binding transcriptional activator GcvA  41 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5808  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2978  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1983  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360577  hitchhiker  0.00420822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1699  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00239277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0722  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2967  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.991326 
 
 
-
 
NC_003296  RS02150  transcription regulator transcription regulator protein  41.02 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2532  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.98 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6358  DNA-binding transcriptional activator GcvA  40 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>