More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0924 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  90.42 
 
 
334 aa  617  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  75.45 
 
 
334 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  76.05 
 
 
334 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  75.75 
 
 
334 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  72.84 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  70.66 
 
 
338 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  72.84 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5580  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  73.43 
 
 
339 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129924  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1057  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  72.54 
 
 
339 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2252  alcohol dehydrogenase  73.43 
 
 
339 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0476734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2276  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  73.43 
 
 
339 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000917722  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1640  zinc-binding alcohol dehydrogenase  73.43 
 
 
339 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00037111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1025  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  73.13 
 
 
339 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0042079  normal  0.442339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  72.24 
 
 
339 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  72.24 
 
 
339 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  72.24 
 
 
339 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  72.24 
 
 
360 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  72.24 
 
 
339 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  71.26 
 
 
338 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  69.94 
 
 
332 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  72.24 
 
 
339 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1295  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.94 
 
 
360 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0519873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  71.26 
 
 
338 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  68.64 
 
 
332 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  69.76 
 
 
328 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.66 
 
 
333 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  68.56 
 
 
334 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.92 
 
 
340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  68.26 
 
 
334 aa  448  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  65.87 
 
 
334 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  65.97 
 
 
333 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  65.27 
 
 
328 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2816  alcohol dehydrogenase  64.07 
 
 
353 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  66.47 
 
 
328 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  61.26 
 
 
332 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.86 
 
 
334 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  60.06 
 
 
341 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  57.49 
 
 
336 aa  361  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  57.49 
 
 
336 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.23 
 
 
334 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  57.49 
 
 
336 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.23 
 
 
326 aa  359  3e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.53 
 
 
331 aa  359  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  56.33 
 
 
334 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.02 
 
 
335 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  58.13 
 
 
332 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.26 
 
 
332 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.66 
 
 
332 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.36 
 
 
335 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0364  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.49 
 
 
332 aa  348  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.430047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.76 
 
 
332 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.86 
 
 
332 aa  346  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  55.42 
 
 
336 aa  345  7e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  56.76 
 
 
332 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.27 
 
 
342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.09 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4346  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.16 
 
 
332 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  54.19 
 
 
389 aa  342  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  55.09 
 
 
325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.29 
 
 
335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.84 
 
 
322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  54.35 
 
 
335 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.52 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.94 
 
 
332 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  55.39 
 
 
328 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  55.39 
 
 
328 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  54.19 
 
 
338 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0568  quinone oxidoreductase putative PIG3  54.65 
 
 
333 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.693956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2964  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  54.46 
 
 
337 aa  331  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.2 
 
 
338 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.57 
 
 
336 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  54.49 
 
 
333 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.82 
 
 
334 aa  329  4e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  53.43 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.68 
 
 
336 aa  325  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.25 
 
 
332 aa  325  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  51.49 
 
 
333 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.29 
 
 
334 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0128  quinone oxidoreductase putative, PIG3  53.89 
 
 
331 aa  322  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180561  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.63 
 
 
328 aa  322  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  54.19 
 
 
328 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.8 
 
 
336 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  49.25 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0064  alcohol dehydrogenase  52.4 
 
 
333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.3 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.6 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  50 
 
 
332 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.05 
 
 
320 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0391  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.23 
 
 
335 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.474725  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4281  alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.672706  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.45 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  48.95 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.45 
 
 
356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.7 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
345 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
345 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0631  quinone oxidoreductase putative PIG3  51.51 
 
 
333 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0658  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.81 
 
 
333 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>