145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0899 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0899  globin  100 
 
 		 147 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  89.68 
 
 		 139 aa  243  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  89.43 
 
 		 134 aa  231  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  85.83 
 
 		 134 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  81.1 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  71.33 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  74.24 
 
 		 164 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  80.99 
 
 		 148 aa  213  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  75.78 
 
 		 137 aa  213  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  80.99 
 
 		 136 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  80.99 
 
 		 136 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  80.99 
 
 		 136 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  80.99 
 
 		 136 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  80.99 
 
 		 136 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  77.24 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  77.24 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  74.22 
 
 		 137 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  74.22 
 
 		 136 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  69.78 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  73.44 
 
 		 136 aa  204  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  72.66 
 
 		 136 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  72.66 
 
 		 136 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  71.88 
 
 		 136 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  62.88 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  63.64 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  58.82 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  59.26 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  63.64 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  63.87 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  60.48 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  57.78 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  58.73 
 
 		 143 aa  158  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  62.81 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  58.68 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  58.2 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  53.42 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  50.78 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  52.42 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  52.89 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  53.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  53.28 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  52.89 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  46.34 
 
 		 142 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  43.88 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  50 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  43.94 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  44.35 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  42.74 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  41.01 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  41.79 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  40.6 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  42.15 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  42.98 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  37.06 
 
 		 145 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  37.06 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  45.53 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  41.8 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  37.06 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  41.41 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  40.46 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  42.74 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  40.46 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  39.69 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  39.69 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  39.84 
 
 		 156 aa  103  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  43.55 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  39.02 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  39.84 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  40.8 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  42.98 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  39.71 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  40.16 
 
 		 130 aa  97.1  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  40.98 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  37.6 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  38.89 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  43.1 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  43.1 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  38.1 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  40.16 
 
 		 133 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  38.1 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  38.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  38.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  48.42 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  38.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  38.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  40.16 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  37.3 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  41.27 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  37.32 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  37.41 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  37.98 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  38.71 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  37.7 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  39.2 
 
 		 173 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  39.1 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  38.52 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  42.74 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>