267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0891 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0891  molybdenum cofactor sulfurylase  100 
 
 		 331 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0014359  normal  0.859862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2427  molybdenum cofactor sulfurylase  83.73 
 
 		 330 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.520292  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2097  xanthine dehydrogenase protein  61.44 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.631742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2248  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.75 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1924  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  58.46 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170465  normal  0.258839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0948  molybdenum cofactor sulfurylase  48.71 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3043  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.32 
 
 		 338 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.438801  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0711  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.65 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  47.26 
 
 		 682 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  47.26 
 
 		 682 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0979  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.26 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0580619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1613  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  48.22 
 
 		 343 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0896  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.43 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0984136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2375  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  45.96 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4132  hypothetical protein  47.63 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0884  hypothetical protein  45.65 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2915  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.22 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0460  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC, putative  48.22 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3020  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  48.22 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.902341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0169  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.22 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0978  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.22 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  48.22 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2975  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  47.9 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0797  molybdenum cofactor sulfurylase  43.79 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44760  putative xanthine dehydrogenase accessory factor X  42.26 
 
 		 279 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.126082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3811  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.61 
 
 		 279 aa  228  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0795  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  61.24 
 
 		 188 aa  228  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.06408  normal  0.122014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3884  putative dehydrogenase  60.67 
 
 		 200 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2420  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  61.67 
 
 		 196 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.245646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1813  hypothetical protein  43.3 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3662  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  43.25 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2302  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  42.81 
 
 		 255 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2550  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  66.45 
 
 		 211 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.748335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3462  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  41.4 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2753  molybdenum cofactor sulfurylase  40.27 
 
 		 276 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0730  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  61.14 
 
 		 220 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0713  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  66.01 
 
 		 220 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3926  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  62.21 
 
 		 205 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.672266  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0806  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  65.38 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0350  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  65.38 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0695464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0834  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  65.38 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22270  xanthine dehydrogenase accessory protein  41.41 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0664332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3606  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.41 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4280  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  38.89 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.721718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1795  molybdenum cofactor sulfurylase  39.18 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0771289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1588  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  38.61 
 
 		 281 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.613466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3844  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.22 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1429  hypothetical protein  40.92 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1045  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.8 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2127  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.85 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153424 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1013  hypothetical protein  38.24 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.102248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1125  hypothetical protein  40.47 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309708  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3923  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  39.66 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4866  putative xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  33.01 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0858  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  34.44 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0224  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  40.4 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0366707 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1153  hypothetical protein  38.28 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02517  Xanthine and CO dehydrogenase maturation factor, XdhC/CoxF family protein  33 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1337  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  46.24 
 
 		 470 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1787  molybdenum cofactor sulfurylase  36.86 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4622  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.36 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2426  hypothetical protein  31.63 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2706  hypothetical protein  35.57 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.174742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0453  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.19 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1118  hypothetical protein  37.25 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3322  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.66 
 
 		 267 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3718  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  37.78 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2835  molybdenum cofactor sulfurylase  36.08 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0367  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.99 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.243152  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1790  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  31.73 
 
 		 283 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.207413  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2605  hypothetical protein  32.34 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0497  molybdenum cofactor sulfurylase  37.54 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3136  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  35.54 
 
 		 271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3946  hypothetical protein  38.72 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.055113  normal  0.191467 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3239  hypothetical protein  40.07 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3556  molybdenum cofactor sulfurylase  39.73 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2864  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  36.24 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0935  molybdenum cofactor sulfurylase  35.27 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00742459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1456  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  32.68 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4259  hypothetical protein  35.09 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0351  chaperone XdhC, putative  31.16 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2960  putative xanthine dehydrogenase accessory protein  36.46 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2697  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  29.15 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1638  molybdenum cofactor sulfurylase  32.24 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5194  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.93 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0923  protein of unknown function DUF182  29.25 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0780  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.25 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0257  xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC  30.56 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1142  hypothetical protein  26.48 
 
 		 328 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.722084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  27.33 
 
 		 346 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  27.99 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0325  putative dehydrogenase accessory protein  24.23 
 
 		 286 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0202  hypothetical protein  29.41 
 
 		 246 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  27.02 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0305  protein of unknown function DUF182  26.95 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0344957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2137  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  27.49 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  25.57 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2013  hypothetical protein  24.84 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.416977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  28 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>