More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0837 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0837  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 759 aa  1541    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213171  normal  0.109269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1078  TonB-dependent receptor  42.63 
 
 		 748 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 815 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 745 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 742 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 742 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 732 aa  303  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 734 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  31.21 
 
 		 821 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 753 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 751 aa  276  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 736 aa  271  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 734 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 766 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  30.01 
 
 		 765 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12430  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 753 aa  254  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  28.9 
 
 		 753 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  29.56 
 
 		 768 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  29.8 
 
 		 780 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 760 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 741 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 763 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 719 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 747 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 773 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 733 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  29.37 
 
 		 772 aa  237  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  27.24 
 
 		 743 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 759 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 707 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 748 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 769 aa  234  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 759 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 715 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 748 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 710 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 		 770 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0576  catecholate siderophore receptor Fiu  29.26 
 
 		 754 aa  231  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000714833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 730 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 733 aa  230  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 730 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 710 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 747 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 749 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  28.69 
 
 		 748 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 747 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 748 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 747 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 747 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 730 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 730 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 731 aa  227  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 731 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 694 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 747 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 731 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 731 aa  225  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3914  TonB-dependent receptor, putative  27.5 
 
 		 730 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.96 
 
 		 695 aa  224  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 740 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0376  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 769 aa  218  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12330  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 769 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 792 aa  216  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0992  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 762 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.221466  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1173  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 741 aa  216  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  26.87 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 732 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 757 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1314  putative TonB-dependent receptor protein  28.59 
 
 		 843 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 706 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.45 
 
 		 709 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 706 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  26.74 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  26.74 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  26.88 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  26.88 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  26.89 
 
 		 760 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7102  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 		 790 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3540  putative outer membrane TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 805 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0614736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  26.74 
 
 		 760 aa  210  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0700  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 785 aa  210  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.241055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 749 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 727 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  27.97 
 
 		 705 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2044  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 776 aa  206  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 712 aa  205  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 724 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 793 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0044  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 		 794 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 656 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 793 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>