More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0823 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  660  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  89.85 
 
 
325 aa  577  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  64.78 
 
 
324 aa  414  1e-115  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  58.15 
 
 
328 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  61.04 
 
 
326 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  60.67 
 
 
335 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  50.34 
 
 
324 aa  315  1e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  47.38 
 
 
356 aa  313  2e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  51.62 
 
 
337 aa  314  2e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  47.53 
 
 
329 aa  312  4e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  47.84 
 
 
328 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  47.84 
 
 
328 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.51 
 
 
328 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.5 
 
 
323 aa  305  8e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  45.33 
 
 
330 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.16 
 
 
335 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  45.18 
 
 
330 aa  299  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.51 
 
 
326 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.77 
 
 
328 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.77 
 
 
345 aa  298  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.71 
 
 
336 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.77 
 
 
345 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  46.82 
 
 
337 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.57 
 
 
328 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.32 
 
 
339 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.37 
 
 
333 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  46.08 
 
 
327 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  45.37 
 
 
322 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.18 
 
 
325 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.28 
 
 
360 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.65 
 
 
336 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.31 
 
 
328 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47 
 
 
327 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  48.92 
 
 
334 aa  291  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.42 
 
 
304 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  44.27 
 
 
314 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.9 
 
 
335 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  45.33 
 
 
325 aa  289  5e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.87 
 
 
339 aa  289  5e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  45.33 
 
 
327 aa  289  5e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  46 
 
 
330 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  46 
 
 
330 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  46.98 
 
 
321 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.1 
 
 
331 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  45.72 
 
 
321 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.71 
 
 
344 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.08 
 
 
327 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.53 
 
 
333 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  44.59 
 
 
312 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  43.97 
 
 
334 aa  286  3e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.26 
 
 
336 aa  285  1e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.64 
 
 
339 aa  285  1e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.41 
 
 
349 aa  284  1e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  46.31 
 
 
321 aa  284  2e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.97 
 
 
335 aa  282  6e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  47.55 
 
 
334 aa  282  6e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.38 
 
 
332 aa  282  6e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  45.4 
 
 
324 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.43 
 
 
326 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  43.91 
 
 
330 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.65 
 
 
333 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  44.63 
 
 
323 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.62 
 
 
325 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.97 
 
 
338 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  45.82 
 
 
330 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.85 
 
 
330 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.19 
 
 
335 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.41 
 
 
331 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.19 
 
 
333 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.11 
 
 
324 aa  275  1e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.95 
 
 
330 aa  274  2e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.15 
 
 
328 aa  273  2e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.95 
 
 
334 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.09 
 
 
334 aa  273  4e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  43.88 
 
 
329 aa  272  5e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.56 
 
 
332 aa  272  5e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.95 
 
 
326 aa  272  5e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  43.69 
 
 
325 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.85 
 
 
339 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.33 
 
 
328 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  44 
 
 
320 aa  271  8e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.92 
 
 
322 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  42.68 
 
 
323 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  43.29 
 
 
326 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  46.13 
 
 
330 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  43.14 
 
 
331 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  45.3 
 
 
322 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  44.48 
 
 
331 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.61 
 
 
344 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  43.96 
 
 
362 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 
332 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.81 
 
 
325 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  42.67 
 
 
335 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.25 
 
 
328 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.45 
 
 
334 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.33 
 
 
334 aa  266  3e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.2 
 
 
332 aa  266  3e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.38 
 
 
324 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  42.81 
 
 
324 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  44.97 
 
 
335 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>