87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0793 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  189  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.569474  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2502  hypothetical protein  91.75 
 
 		 97 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1308  hypothetical protein  54.84 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525865  normal  0.365373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4012  hypothetical protein  56.04 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  51.09 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2926  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  53.33 
 
 		 98 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  52.22 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2183  hypothetical protein  58.21 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0463  hypothetical protein  48.1 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  44.55 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  48.1 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  46.84 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  49.37 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4662  hypothetical protein  43.02 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.627824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  47.3 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0592  hypothetical protein  41.77 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  40.48 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0873  protein of unknown function DUF1232  38.37 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0685526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  39.33 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1795  hypothetical protein  41.03 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1079  hypothetical protein  45.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2623  hypothetical protein  36.17 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2189  hypothetical protein  41.67 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124091  hitchhiker  0.000597226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4882  protein of unknown function DUF1232  40.62 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3216  hypothetical protein  36.9 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.944113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1309  hypothetical protein  39.24 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  31.03 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5698  hypothetical protein  36.9 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  38.67 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0456  protein of unknown function DUF1232  30 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  33.75 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3856  hypothetical protein  43.21 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0230903  normal  0.0305359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3871  hypothetical protein  41.86 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2543  hypothetical protein  46.55 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  38.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  38.67 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  35 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  35.21 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1462  protein of unknown function DUF1232  41.46 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.583508  normal  0.293258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2657  hypothetical protein  32.39 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90763  hitchhiker  0.00677971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1363  protein of unknown function DUF1232  40.74 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00386396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0941  hypothetical protein  38.04 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000582601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0560  hypothetical protein  43.04 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0754  hypothetical protein  34.88 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0234  hypothetical protein  32.43 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.74255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  35.06 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0024  protein of unknown function DUF1232  31.88 
 
 		 87 aa  47.4  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  30.43 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4217  hypothetical protein  31.94 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  39.62 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  34.21 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  38.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  29.17 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  30.56 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  48.72 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  35.19 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  35.19 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3655  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  28.38 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  28.79 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  69.23 
 
 		 95 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1921  hypothetical protein  44.19 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  37.7 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  37.7 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  40.48 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1449  hypothetical protein  51.35 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.808576  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0594  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>