More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0776 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  100 
 
 		 447 aa  891    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  63.13 
 
 		 452 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  41.8 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 440 aa  275  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  37.32 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  37.09 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 442 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 442 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 444 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 453 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 449 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 438 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 506 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.9 
 
 		 475 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 433 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 467 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 441 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.15 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.04 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  23.85 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  23.85 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 443 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 542 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 578 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 536 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 421 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  32.2 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 436 aa  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  25.14 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 530 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  24.29 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  24.29 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>