153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0760 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  85.57 
 
 		 405 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  100 
 
 		 408 aa  824    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  54.62 
 
 		 382 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  53.77 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  51.85 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  51.85 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  54.05 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  54.05 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  48.68 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  48.68 
 
 		 382 aa  352  8e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  38.6 
 
 		 389 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  37.34 
 
 		 389 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  37.23 
 
 		 406 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  36.32 
 
 		 452 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  37.23 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  37.5 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  35.26 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  35.53 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  35.7 
 
 		 379 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  38.22 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  35.43 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  36.34 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  33.51 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  34.55 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  35.42 
 
 		 379 aa  195  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  35.85 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  35.83 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  32.98 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  37.43 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  32.72 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  34.82 
 
 		 381 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  32.72 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  36.27 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  34.81 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  32.46 
 
 		 378 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  34.11 
 
 		 389 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  36.72 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  32.2 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  33.98 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  32.82 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  33.68 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  38.22 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  35.54 
 
 		 373 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  33.51 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  33.51 
 
 		 377 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  34.9 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  32.2 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  32.2 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  32.2 
 
 		 378 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  35.16 
 
 		 379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  33.68 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  34.03 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  33.24 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  33.68 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  34.02 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  34.26 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  32.99 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  34.82 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  34.82 
 
 		 378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  32.45 
 
 		 378 aa  183  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  32.21 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  35.36 
 
 		 392 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  36.73 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  34.91 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  34.29 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  32.81 
 
 		 378 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  34.27 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  32.8 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  36.66 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  35.7 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  35.98 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  33.51 
 
 		 383 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  33.86 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  33.16 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  33.78 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  34.54 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  34.2 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  33.77 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  31.68 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  31.68 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  32.72 
 
 		 380 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  33.51 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  34.21 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  36.16 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  35.4 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  34.62 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  37.54 
 
 		 589 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5867  hypothetical protein  32.54 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3662  metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism-like protein  45.59 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  29.9 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>