More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0736 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  89.06 
 
 		 265 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  69.89 
 
 		 266 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  68.18 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  71 
 
 		 266 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  71 
 
 		 266 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  72.35 
 
 		 264 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  72.35 
 
 		 264 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  71.21 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  72.35 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  70.83 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  75.31 
 
 		 265 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  72.02 
 
 		 272 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  76.27 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  70.83 
 
 		 264 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  67.55 
 
 		 281 aa  358  5e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  74.17 
 
 		 266 aa  357  8e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  69.06 
 
 		 266 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  69.06 
 
 		 266 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  74.06 
 
 		 265 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.22 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  60.74 
 
 		 270 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.56 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.56 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.42 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  68.54 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  59.85 
 
 		 268 aa  322  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  59.26 
 
 		 270 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  67.67 
 
 		 266 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  70.49 
 
 		 259 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  70.08 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  71.61 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  66.81 
 
 		 246 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  57.35 
 
 		 297 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  63.14 
 
 		 258 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  62.55 
 
 		 529 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  56.46 
 
 		 271 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  63.14 
 
 		 262 aa  308  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  58.33 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  58.33 
 
 		 269 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  58.33 
 
 		 266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  56.46 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  56.46 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  56.46 
 
 		 271 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  55.94 
 
 		 259 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  56.83 
 
 		 271 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  60.59 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  58.69 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  58.69 
 
 		 259 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  61.41 
 
 		 268 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  57.58 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  57.58 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  56.09 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  56.09 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  56.67 
 
 		 274 aa  304  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  58.3 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  60.58 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  55.17 
 
 		 259 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  60.59 
 
 		 259 aa  301  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  59.43 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  54.79 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  56.25 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  56.76 
 
 		 271 aa  299  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.62 
 
 		 272 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  56.25 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  59.43 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  59.43 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.25 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.25 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.25 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.25 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  56.25 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  57.47 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  59.43 
 
 		 268 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  59.02 
 
 		 268 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  59.43 
 
 		 268 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  56.52 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  57.58 
 
 		 258 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  59.02 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  59.31 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  58.13 
 
 		 262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  56.36 
 
 		 257 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  51.74 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  52.76 
 
 		 258 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  55.74 
 
 		 269 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  56.36 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  55.74 
 
 		 263 aa  274  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  54.24 
 
 		 278 aa  272  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  53.91 
 
 		 286 aa  271  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  54.01 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.01 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  55.02 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  49.43 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  49.43 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  49.43 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.43 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.24 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.24 
 
 		 270 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  55.9 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  49.06 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>