More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0721 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  89.04 
 
 		 221 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  67.76 
 
 		 231 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  67.29 
 
 		 231 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  65.75 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  69.48 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  69.48 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  69.48 
 
 		 228 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  69.01 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  67.61 
 
 		 228 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  69.05 
 
 		 228 aa  271  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  68.1 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  68.57 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  68.1 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  68.1 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  68.1 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  68.1 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  68.1 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  66.67 
 
 		 228 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  66.2 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0922  cytidylate kinase  69.48 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0926  cytidylate kinase  69.01 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2258  cytidylate kinase  69.48 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  62.04 
 
 		 673 aa  256  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  62.04 
 
 		 673 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.33 
 
 		 668 aa  244  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1309  cytidylate kinase  60 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000117223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  56.87 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  56.87 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0499  cytidylate kinase  60 
 
 		 220 aa  241  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0933266  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  59.81 
 
 		 679 aa  237  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  56.74 
 
 		 675 aa  232  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  59.72 
 
 		 674 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  55 
 
 		 667 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  55.4 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.94 
 
 		 699 aa  225  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1567  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.48 
 
 		 669 aa  224  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  56.07 
 
 		 705 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  57.08 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  57.94 
 
 		 670 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  58.71 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  52.05 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  53.74 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  52.34 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  53.92 
 
 		 229 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  53.08 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  51.6 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  52.31 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  51.85 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  52.11 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  53.3 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  52.31 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  54.42 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  52.53 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  50.68 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  48.85 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  52.83 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  47.47 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  52.38 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  52.78 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  47.27 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  53.02 
 
 		 229 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1078  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0687941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1013  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0567176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0986  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1093  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0104083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1045  cytidylate kinase  50.46 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.185526  normal  0.763998 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  49.07 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  52.36 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  49.07 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  50.93 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  49.07 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  50.7 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.88 
 
 		 653 aa  205  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  50 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  51.16 
 
 		 229 aa  204  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  50.93 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  52.13 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  50 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  58.37 
 
 		 643 aa  202  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  51.42 
 
 		 225 aa  201  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  50 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  50.72 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  50.47 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2856  cytidylate kinase  50.94 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000021992  hitchhiker  0.0000000124191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  48.17 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>