More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0704 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  62.63 
 
 		 755 aa  825    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  54.46 
 
 		 727 aa  765    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  86.96 
 
 		 886 aa  1538    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  60.73 
 
 		 751 aa  878    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  89.13 
 
 		 878 aa  1572    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  59.86 
 
 		 748 aa  787    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  86.96 
 
 		 886 aa  1538    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  58.72 
 
 		 741 aa  839    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  59.15 
 
 		 727 aa  828    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  64.08 
 
 		 746 aa  907    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  54.76 
 
 		 730 aa  783    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  60.66 
 
 		 722 aa  853    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  59.51 
 
 		 743 aa  834    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 883 aa  1778    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  61.66 
 
 		 730 aa  829    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  50.17 
 
 		 871 aa  825    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  60.05 
 
 		 744 aa  810    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  54.76 
 
 		 723 aa  772    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  56.49 
 
 		 723 aa  797    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  42.92 
 
 		 856 aa  635  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  43.34 
 
 		 856 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  42.76 
 
 		 858 aa  623  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  40.97 
 
 		 896 aa  614  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  42.3 
 
 		 875 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  43.93 
 
 		 855 aa  599  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  42.91 
 
 		 865 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  44.16 
 
 		 862 aa  595  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  43.4 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  43.04 
 
 		 855 aa  592  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  43.4 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  42.36 
 
 		 856 aa  595  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  40.49 
 
 		 857 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  41.97 
 
 		 861 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  41.97 
 
 		 861 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  41.2 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  43.14 
 
 		 861 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  41.84 
 
 		 890 aa  572  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.31 
 
 		 879 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.54 
 
 		 894 aa  552  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  37.17 
 
 		 876 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  38.59 
 
 		 877 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  38.48 
 
 		 877 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  41.71 
 
 		 872 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.21 
 
 		 895 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.76 
 
 		 901 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  38.07 
 
 		 894 aa  528  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  38.45 
 
 		 879 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  36.93 
 
 		 902 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  38.51 
 
 		 914 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  37.44 
 
 		 906 aa  519  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  39.12 
 
 		 908 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.72 
 
 		 900 aa  505  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  37.72 
 
 		 918 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.01 
 
 		 885 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  34 
 
 		 893 aa  486  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  34.5 
 
 		 882 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  33.91 
 
 		 887 aa  479  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.82 
 
 		 939 aa  472  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  36.07 
 
 		 910 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  36.98 
 
 		 881 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  31.06 
 
 		 874 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  30.7 
 
 		 874 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  34.22 
 
 		 622 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  29.98 
 
 		 637 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.22 
 
 		 636 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  32.13 
 
 		 647 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.76 
 
 		 664 aa  178  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.11 
 
 		 778 aa  165  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  29 
 
 		 646 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.78 
 
 		 778 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  22.12 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.57 
 
 		 755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  35.62 
 
 		 579 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  36.53 
 
 		 581 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.86 
 
 		 755 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.1 
 
 		 573 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.95 
 
 		 585 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.51 
 
 		 757 aa  140  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  27.91 
 
 		 1086 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.71 
 
 		 754 aa  139  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  30.7 
 
 		 538 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 1103 aa  138  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 		 593 aa  138  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32 
 
 		 328 aa  137  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 		 588 aa  137  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  36.34 
 
 		 594 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  34.76 
 
 		 585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  34.47 
 
 		 581 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.09 
 
 		 569 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 		 581 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  26.63 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  34.47 
 
 		 581 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  34.16 
 
 		 581 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 582 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  34.57 
 
 		 571 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  31.78 
 
 		 572 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  27.16 
 
 		 584 aa  127  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  31.66 
 
 		 597 aa  127  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  32.19 
 
 		 582 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>