More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0695 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  78.08 
 
 		 438 aa  712    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  69.21 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  69.21 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  88.48 
 
 		 434 aa  803    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0692  seryl-tRNA synthetase  70.11 
 
 		 436 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.96441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  78.9 
 
 		 438 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 427 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  69.21 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  69.21 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  69.89 
 
 		 433 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1159  seryl-tRNA synthetase  70.34 
 
 		 436 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  69.14 
 
 		 433 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  69.21 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  71.53 
 
 		 431 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  68.98 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 435 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  69.66 
 
 		 431 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  69.21 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  78.59 
 
 		 438 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 433 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  69.66 
 
 		 433 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  70.11 
 
 		 432 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 433 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 433 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  68.74 
 
 		 433 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  67.82 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  68.98 
 
 		 430 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  68.29 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  66.2 
 
 		 432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  65.9 
 
 		 432 aa  591  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 438 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  66.28 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  62.11 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 468 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  64.67 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  64.67 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  64.43 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  64.67 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  64.9 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  63.28 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  63.62 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 444 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  63.27 
 
 		 452 aa  565  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 426 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  63.26 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  62.12 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  63.26 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  63.26 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 428 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2456  seryl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00287072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  60.51 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 424 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  62.18 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  63.02 
 
 		 426 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  63.02 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  62.36 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  62.33 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  59.81 
 
 		 428 aa  552  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 443 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  62.09 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  60.92 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  62.79 
 
 		 426 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 427 aa  551  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 442 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  62.19 
 
 		 442 aa  549  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 426 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  60.37 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>