More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0684 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  100 
 
 
317 aa  652  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  85.67 
 
 
321 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1037  thioredoxin reductase  84.13 
 
 
333 aa  557  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.526099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3442  thioredoxin reductase  82.86 
 
 
333 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0634  thioredoxin reductase  81.59 
 
 
333 aa  547  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  82.54 
 
 
320 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  82.54 
 
 
320 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0834  thioredoxin reductase  81.9 
 
 
346 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  82.54 
 
 
320 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  80.32 
 
 
320 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0846  thioredoxin reductase  81.9 
 
 
320 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  81.9 
 
 
320 aa  544  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4077  thioredoxin reductase  81.59 
 
 
346 aa  540  1e-152  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2557  thioredoxin reductase  80.44 
 
 
318 aa  537  1e-152  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  80 
 
 
320 aa  539  1e-152  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2342  thioredoxin reductase oxidoreductase protein  80.57 
 
 
318 aa  537  1e-152  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2153  thioredoxin reductase  79.81 
 
 
318 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.969122  normal  0.900366 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1162  thioredoxin reductase  79.43 
 
 
318 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.238547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0689  thioredoxin reductase  79.68 
 
 
318 aa  531  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.200381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  78.8 
 
 
316 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  76.58 
 
 
317 aa  520  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0023  thioredoxin reductase  74.76 
 
 
316 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.459849  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  75.72 
 
 
317 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  75.4 
 
 
317 aa  506  1e-142  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  75.4 
 
 
319 aa  506  1e-142  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1758  thioredoxin reductase  75.88 
 
 
326 aa  507  1e-142  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.852508  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  75.16 
 
 
316 aa  504  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3213  thioredoxin reductase  75.88 
 
 
314 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.166551  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  73.89 
 
 
337 aa  501  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1001  thioredoxin reductase  74.68 
 
 
345 aa  501  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.24844  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3801  thioredoxin reductase  75.56 
 
 
328 aa  501  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3179  thioredoxin reductase  73.8 
 
 
316 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1283  thioredoxin reductase  74.6 
 
 
319 aa  497  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  73.63 
 
 
317 aa  492  1e-138  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1443  thioredoxin reductase  72.35 
 
 
352 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1681  thioredoxin reductase  72.06 
 
 
323 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  0.152153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0248  thioredoxin reductase  73.16 
 
 
319 aa  484  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2233  thioredoxin reductase  72.7 
 
 
321 aa  484  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000186252  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1769  thioredoxin reductase  74.44 
 
 
317 aa  484  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.46804e-07  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0962  thioredoxin reductase  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.9736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1050  thioredoxin reductase  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000235297  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1838  thioredoxin reductase  72.7 
 
 
321 aa  481  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00899  hypothetical protein  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1023  thioredoxin reductase  73.02 
 
 
322 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00170984  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0963  thioredoxin reductase  73.02 
 
 
322 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.79645e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00892  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2708  thioredoxin reductase  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.08143e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  73.16 
 
 
319 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2755  thioredoxin reductase  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.54011e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0992  thioredoxin reductase  72.38 
 
 
321 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.6798e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  73.48 
 
 
319 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1057  thioredoxin reductase  73.02 
 
 
322 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00951777  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0803  thioredoxin reductase  72.61 
 
 
318 aa  482  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1072  thioredoxin reductase  73.02 
 
 
322 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00976208  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  70.48 
 
 
320 aa  481  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0991  thioredoxin reductase  73.02 
 
 
322 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0860266  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0754  thioredoxin reductase  73.31 
 
 
321 aa  477  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2441  thioredoxin reductase  72.06 
 
 
321 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.26981e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  69.4 
 
 
316 aa  474  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  6.34849e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3225  thioredoxin reductase  70.29 
 
 
319 aa  474  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00279715  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1412  thioredoxin reductase  71.11 
 
 
322 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00718409  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2047  thioredoxin reductase  71.97 
 
 
317 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  8.27938e-07  hitchhiker  0.00204856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2303  thioredoxin reductase  71.97 
 
 
317 aa  471  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2028  thioredoxin reductase  72.52 
 
 
316 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.02058e-05  hitchhiker  2.62597e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  70.16 
 
 
320 aa  471  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.52855e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0488  thioredoxin reductase  71.92 
 
 
316 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.723059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  70.16 
 
 
320 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  72.06 
 
 
317 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.42143e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  69.65 
 
 
317 aa  471  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1148  thioredoxin reductase  70.38 
 
 
317 aa  471  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.604332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  71.75 
 
 
320 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  70.16 
 
 
320 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  71.11 
 
 
320 aa  469  1e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  71.43 
 
 
318 aa  470  1e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  70.57 
 
 
319 aa  468  1e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1753  thioredoxin reductase  71.06 
 
 
317 aa  468  1e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  70.57 
 
 
316 aa  469  1e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.07332e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1932  thioredoxin reductase  71.43 
 
 
317 aa  468  1e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  5.20435e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2017  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
317 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000213161  normal  0.0579886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1959  thioredoxin reductase  71.66 
 
 
317 aa  470  1e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.55114e-08  normal  0.552411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  69.33 
 
 
320 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2152  thioredoxin reductase  70.7 
 
 
317 aa  464  1e-130  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.85942e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  69.33 
 
 
320 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  69.33 
 
 
320 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2258  thioredoxin reductase  71.57 
 
 
316 aa  465  1e-130  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.69147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2218  thioredoxin reductase  70.7 
 
 
317 aa  464  1e-130  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.23307e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0763  thioredoxin reductase  67.19 
 
 
319 aa  466  1e-130  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2188  thioredoxin reductase  70.7 
 
 
317 aa  464  1e-130  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.84195e-05  normal  0.0220787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  69.33 
 
 
320 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2014  thioredoxin reductase  70.7 
 
 
317 aa  464  1e-130  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000856982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  68.79 
 
 
316 aa  464  1e-130  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  69.43 
 
 
320 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  69.33 
 
 
320 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2762  thioredoxin-disulfide reductase  70.61 
 
 
315 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>