More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0642 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  73.05 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  50.38 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  43.54 
 
 		 402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  42.59 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  42.59 
 
 		 402 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  42.59 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  41.12 
 
 		 402 aa  318  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  43 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  42.75 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  41.16 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  39.09 
 
 		 397 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  41.18 
 
 		 397 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  38.62 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  38.32 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  36.24 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  32.66 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  33.42 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  32.44 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.92 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.26 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.25 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  27.87 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  26.11 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  24.36 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  25.69 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  26.65 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  24.21 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  26.1 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.72 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  27.13 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.5 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.33 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  28.66 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  26.07 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2382  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47935  normal  0.228311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3793  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162082  normal  0.418214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.91 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  28.35 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  26.3 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  25.16 
 
 		 580 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  22.94 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2829  response regulator receiver protein  24.06 
 
 		 414 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.906535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.4 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4191  pilus assembly protein CpaE  24.83 
 
 		 528 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3522  putative pilus assembly protein cpaE  24.62 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2482  putative pilus assembly protein CpaE  23.75 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  23 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  23.75 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.52 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1782  pilus assembly protein cpaE  24.1 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.216369  normal  0.120682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.2 
 
 		 587 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.15 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  26.93 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2705  putative pilus assembly protein CpaE  23.44 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.383675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.11 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.15 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2410  response regulator receiver protein  22.5 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.53 
 
 		 414 aa  89.7  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0389  pilus assembly protein CpaE  23.33 
 
 		 422 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3715  putative pilus assembly protein cpaE  23.75 
 
 		 423 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.522305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  23.33 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0235  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.695166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0215  component of type IV pilus  23.05 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4202  putative pilus assembly protein CpaE  23.13 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.83 
 
 		 395 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0299  pilus assembly protein cpaE  23.58 
 
 		 421 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  21.75 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.04 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.06 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7033  putative pilus assembly protein cpaE  22.96 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.186488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.92 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.96 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  25.44 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.45 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0421  response regulator receiver protein  24.15 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3789  response regulator receiver protein  22 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  19.09 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  21.45 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5685  putative pilus assembly protein cpaE  23.08 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.744074  normal  0.310447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  24.63 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  21.43 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  22.7 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4398  response regulator receiver protein  23.46 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  25.42 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  21.1 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>