105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0634 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  77.44 
 
 		 524 aa  777    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  100 
 
 		 523 aa  1034    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  49.14 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  43.27 
 
 		 533 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  43.5 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  42.75 
 
 		 533 aa  395  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  40.9 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  41.64 
 
 		 534 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  42.77 
 
 		 530 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  39 
 
 		 791 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  30.02 
 
 		 508 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  28.18 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  25.35 
 
 		 790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  26.67 
 
 		 789 aa  107  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  27.11 
 
 		 498 aa  103  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  25.42 
 
 		 518 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  27.2 
 
 		 518 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  26.36 
 
 		 520 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  25.25 
 
 		 518 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  30.52 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  30.52 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1100  type VI secretion-associated protein, family  30.68 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  22.09 
 
 		 513 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  29.32 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  21.2 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  19.75 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  29.88 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0747  hypothetical protein  41.6 
 
 		 642 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.449212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0530  ImpA-like N-terminal family protein  41.6 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.961016  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0601  hypothetical protein  41.6 
 
 		 630 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0712  hypothetical protein  41.6 
 
 		 638 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2022  ImpA-related N-terminal family protein  41.6 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1668  ImpA-related N-terminal family protein  41.6 
 
 		 653 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.894506  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2120  ImpA-related N-terminal family protein  40.8 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570001  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0873  ImpA-like N-terminal family protein  40.77 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  25.95 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  25.74 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  24.61 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0018  hypothetical protein  26.46 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  24.64 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1098  ImpA domain protein  27.66 
 
 		 453 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1217  ImpA domain-containing protein  27.66 
 
 		 454 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249719  normal  0.176595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  33.66 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  33.66 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0225  ImpA domain-containing protein  33.91 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.347157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0227  ImpA domain-containing protein  33.91 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0233  ImpA domain protein  33.91 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.845449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  36.36 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  36.36 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  36.36 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  25.13 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  24.87 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  34.55 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  34.26 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  26.72 
 
 		 480 aa  57  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  35.71 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  25.76 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  30.09 
 
 		 533 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  23.33 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2517  type VI secretion-associated protein  25.99 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  33.65 
 
 		 367 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3243  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  24.5 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  30.69 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.56 
 
 		 373 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  31.03 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  31.01 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  31.78 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  31.78 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.92 
 
 		 373 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1094  ImpA domain protein  27.21 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  31.01 
 
 		 373 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  42.86 
 
 		 371 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.35 
 
 		 369 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  27.82 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2583  ImpA domain-containing protein  29.2 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  32.76 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  25.44 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  30.23 
 
 		 373 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.23 
 
 		 373 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  32.04 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  32.04 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  32.04 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  32.04 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  32.04 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  28.32 
 
 		 455 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  28.32 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  33.96 
 
 		 344 aa  45.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  22.12 
 
 		 437 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  32.04 
 
 		 367 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  32.04 
 
 		 345 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.23 
 
 		 360 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  25.95 
 
 		 312 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>