65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0578 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  68.39 
 
 		 207 aa  258  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  37.71 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  37.74 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  37.42 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1444  hypothetical protein  37.37 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  37.74 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  37.74 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  37.11 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  39.52 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  39.58 
 
 		 233 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  37.11 
 
 		 238 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 256 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  37.72 
 
 		 256 aa  98.2  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  38.99 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 256 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 252 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  37.72 
 
 		 239 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 252 aa  98.2  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  37.72 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  34.36 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0600  hypothetical protein  39.89 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  32.64 
 
 		 253 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0529  hypothetical protein  41.48 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  32.83 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0516  protein of unknown function DUF330  40.58 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  33.71 
 
 		 233 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  34.12 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5803  hypothetical protein  33.7 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000107973  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  31.69 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  30.11 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  31.22 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000082506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  32.12 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  34.03 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  30.93 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6815  hypothetical protein  34.34 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  29.59 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  32.43 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  30.2 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  31.58 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  31.33 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  34.07 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.51 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.621383 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  30.26 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  26.57 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  29.1 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  27.74 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  27.96 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  27.13 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2578  hypothetical protein  30.86 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3138  hypothetical protein  29.81 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  26.85 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  29.63 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  24.87 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 472 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  37.5 
 
 		 472 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3287  hypothetical protein  28.57 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762664 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  37.5 
 
 		 464 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  33.68 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>