More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0562 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  80.99 
 
 		 407 aa  670    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  100 
 
 		 405 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  53.45 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  52.41 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  49.88 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  49.63 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  52.11 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  50.89 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.53 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  51.12 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  50 
 
 		 392 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  50.5 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  48.25 
 
 		 1305 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  46.27 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  50.25 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  49.51 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  48.99 
 
 		 393 aa  348  7e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  49.75 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  48.24 
 
 		 402 aa  345  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  46.37 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  49.62 
 
 		 400 aa  338  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  48.21 
 
 		 393 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  47.24 
 
 		 402 aa  339  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  48.63 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  48 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  47.24 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  51.41 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  50.13 
 
 		 390 aa  335  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  49.5 
 
 		 399 aa  335  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  50.38 
 
 		 402 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  46.87 
 
 		 392 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  48.76 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  48.12 
 
 		 1230 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  48.37 
 
 		 398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  49.87 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  46.67 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  47.04 
 
 		 394 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  48.12 
 
 		 1228 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  46.55 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  47.62 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.2 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.2 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  51.38 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  51.38 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  49.1 
 
 		 389 aa  315  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  45.61 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  45.61 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  45.36 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  48.36 
 
 		 1230 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  45.36 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  45.36 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  45.36 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  47.13 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  46.13 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  47.42 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  43.89 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.22 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.5 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  44.64 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  45.83 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  44.61 
 
 		 397 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  45 
 
 		 412 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  47.03 
 
 		 416 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  43.54 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  44.99 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  43.54 
 
 		 372 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  47.51 
 
 		 389 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  44.25 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  44.25 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  45.2 
 
 		 371 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  42.82 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  42.71 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  45.96 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  43.56 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  45.23 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  42.48 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  43.8 
 
 		 401 aa  282  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  45.78 
 
 		 399 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  44.59 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.74 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  42.33 
 
 		 413 aa  275  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  38.69 
 
 		 398 aa  275  8e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.65 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  44.28 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  39.32 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  40.92 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  40.92 
 
 		 403 aa  270  5e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  45.76 
 
 		 367 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42.68 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  41.48 
 
 		 589 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  43.11 
 
 		 392 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  40.2 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  39.29 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  39.13 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  40.73 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  40.44 
 
 		 404 aa  264  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  40.75 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  39.22 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>