86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0547 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  74.44 
 
 		 463 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  84.58 
 
 		 467 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  85.01 
 
 		 467 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  84.58 
 
 		 467 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  82.66 
 
 		 467 aa  713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  82.66 
 
 		 467 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  82.66 
 
 		 467 aa  713    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  82.66 
 
 		 467 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  82.66 
 
 		 467 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  77.25 
 
 		 466 aa  690    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  86.27 
 
 		 466 aa  765    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  72.57 
 
 		 463 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  82.62 
 
 		 466 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  74.44 
 
 		 463 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  72.79 
 
 		 463 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  85.01 
 
 		 467 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  74.95 
 
 		 463 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  84.58 
 
 		 467 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  84.37 
 
 		 495 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  74.66 
 
 		 463 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  73.32 
 
 		 463 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  86.39 
 
 		 463 aa  740    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  76.18 
 
 		 466 aa  647    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  77.47 
 
 		 466 aa  692    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  82.66 
 
 		 467 aa  713    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  73 
 
 		 463 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  73.55 
 
 		 465 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  100 
 
 		 463 aa  906    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  82.66 
 
 		 467 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  73.87 
 
 		 463 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  84.58 
 
 		 467 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  83.08 
 
 		 467 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  86.48 
 
 		 466 aa  770    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  72.42 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  69.96 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  68.61 
 
 		 463 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  68.61 
 
 		 463 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  69.11 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  67.1 
 
 		 463 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  67.1 
 
 		 463 aa  601  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  68.82 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  63.58 
 
 		 466 aa  541  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  56.99 
 
 		 465 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  57.29 
 
 		 479 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  56.69 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  56.69 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  56.9 
 
 		 479 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  56.49 
 
 		 479 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  56.49 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  56.49 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  56.49 
 
 		 479 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  55.49 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  56.77 
 
 		 479 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  55.34 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  55.12 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  56.99 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  46.56 
 
 		 464 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  44.81 
 
 		 462 aa  352  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  46.86 
 
 		 463 aa  339  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  44.04 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  43.27 
 
 		 471 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  42.44 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  46.53 
 
 		 461 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  42.95 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  38.62 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  38.76 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  41.41 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  39.76 
 
 		 521 aa  298  2e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  44.14 
 
 		 469 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  39.27 
 
 		 489 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  42.65 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  38.69 
 
 		 487 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  40.13 
 
 		 483 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  39.33 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  36.82 
 
 		 491 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  38.05 
 
 		 484 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  35.34 
 
 		 479 aa  240  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  37.69 
 
 		 484 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  36.16 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  34.49 
 
 		 431 aa  202  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  35.32 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  35.26 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  69.09 
 
 		 141 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  69.09 
 
 		 141 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  69.09 
 
 		 141 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  69.09 
 
 		 141 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>