71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0500 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 350 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  66.57 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  54.19 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.5 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.07 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  25.69 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.99 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.43 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  21.95 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  22.82 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  24.72 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  23.33 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  28.53 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.89 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 377 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  23.64 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  36.47 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  22.99 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.24 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 385 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  23.47 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 		 588 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  22.35 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  21.35 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  22.22 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0766  response regulator receiver protein  21.52 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  19.55 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  22.22 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  44.68 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  21.88 
 
 		 367 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>