70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0498 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0498  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 107 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  63.55 
 
 		 107 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  64.49 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0562  hypothetical protein  72.9 
 
 		 107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0569  hypothetical protein  66.36 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2629  branched-chain amino acid transport  54.72 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2018  branched-chain amino acid transport  54.72 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2658  branched-chain amino acid transport  54.72 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3278  branched-chain amino acid transport  52.83 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.619269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5960  hypothetical protein  53.77 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0662  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0669  branched-chain amino acid transport  53.77 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0458  branched-chain amino acid transport  52.83 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.325942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0836  AzlD family protein  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0036  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0832  AzlD family protein  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2423  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0590  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0295  hypothetical protein  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.856609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2676  branched-chain amino acid transport  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2549  branched-chain amino acid transport  51.89 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0554296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4636  branched-chain amino acid transport  41.12 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0688  hypothetical protein  48.11 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1273  branched-chain amino acid transport  42.45 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3875  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0829  branched-chain amino acid transport  36.79 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  37.62 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0354  branched-chain amino acid transport  35.24 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0971347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5109  branched-chain amino acid transport  37.5 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0376343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  36.11 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4055  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.461564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3400  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.737178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  38.68 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4692  branched-chain amino acid transport  40.38 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0288  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1380  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.551237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  31.58 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1416  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  34.69 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  29.91 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  31 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  34.29 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  32.08 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2853  hypothetical protein  26.67 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.438366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3972  branched-chain amino acid transport  32.71 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.573883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0403  branched-chain amino acid transport  36.14 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.661242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0388  branched-chain amino acid transport  34.94 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0803  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2208  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0507422  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1047  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473278  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0971  branched-chain amino acid transport  30.85 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00496866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0975  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00167089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  32.53 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1759  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4124  hypothetical protein  34.44 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2937  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00590698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2783  branched-chain amino acid transport  29.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  0.341399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1566  branched-chain amino acid transport  29.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  30.23 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2108  branched-chain amino acid transport  29.55 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1560  branched-chain amino acid transport  29.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1597  branched-chain amino acid transport  29.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  26.8 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2540  hypothetical protein  31.91 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.137358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4208  hypothetical protein  30.43 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000158916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06281  hypothetical protein  34 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0616  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 112 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441128  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1095  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 112 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000116861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1054  branched-chain amino acid transport  30.43 
 
 		 112 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416307  normal  0.939947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>