More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0496 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  82.16 
 
 		 433 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  875    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  54.15 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 420 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  53.03 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  52.8 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 411 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  47.55 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 409 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 409 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  44.99 
 
 		 428 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 428 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  45.1 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 428 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  45.34 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 435 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 409 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  43.34 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  41.8 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  41.8 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  41.8 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  42.56 
 
 		 474 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  40.97 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  42.09 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  42.09 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  42.46 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  42.09 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  42.09 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  42.27 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  40.05 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 432 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  41.94 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  41.94 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  41.94 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  40.96 
 
 		 424 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 428 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 415 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  36.97 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 415 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  33.08 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 410 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  28.47 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.75 
 
 		 432 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.75 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.75 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  27.81 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 425 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>