More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0444 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
253 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0505  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.26 
 
 
249 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.64 
 
 
250 aa  362  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  70.04 
 
 
250 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  68.83 
 
 
250 aa  358  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.9 
 
 
254 aa  324  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  62.7 
 
 
254 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.3 
 
 
254 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.3 
 
 
254 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  62.3 
 
 
254 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.51 
 
 
254 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  60 
 
 
244 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.11 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  61.35 
 
 
259 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.96 
 
 
244 aa  311  7.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  61.22 
 
 
252 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  60.16 
 
 
259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.82 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.43 
 
 
252 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.6 
 
 
255 aa  248  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  49.18 
 
 
254 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.78 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.99 
 
 
256 aa  238  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.13 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.76 
 
 
249 aa  234  9e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.35 
 
 
249 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.12 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4174  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.81 
 
 
251 aa  228  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  0.278578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.37 
 
 
240 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.92 
 
 
283 aa  225  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.15 
 
 
258 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0957  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.47 
 
 
252 aa  218  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.94 
 
 
258 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.68 
 
 
283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.33 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.4 
 
 
251 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.92 
 
 
248 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.35 
 
 
270 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.13 
 
 
250 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.42 
 
 
248 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  40.24 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  40.24 
 
 
257 aa  178  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.65 
 
 
249 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.63 
 
 
253 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5696  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.05 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.226605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  34.76 
 
 
236 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.76 
 
 
251 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.48 
 
 
255 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  37.76 
 
 
249 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0077  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.08 
 
 
256 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000191625  decreased coverage  0.0000000000082307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7109  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.91 
 
 
240 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.135036 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.21 
 
 
257 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 
240 aa  154  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.68 
 
 
256 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.39 
 
 
261 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  38.2 
 
 
242 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  35.27 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0007  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.67 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000602556  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.39 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.39 
 
 
261 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.25 
 
 
262 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  35.71 
 
 
268 aa  142  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.16 
 
 
259 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4243  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.35 
 
 
250 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0459048  hitchhiker  0.000000000931416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.05 
 
 
255 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.46 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.17 
 
 
269 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.18 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  36 
 
 
250 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.35 
 
 
269 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.19 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  32.22 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.61 
 
 
257 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.98 
 
 
255 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  31.33 
 
 
260 aa  123  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 
242 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  34.76 
 
 
242 aa  123  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.33 
 
 
300 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.56 
 
 
261 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  34.85 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.42 
 
 
228 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.87 
 
 
264 aa  118  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.49 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.84 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.02 
 
 
273 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.03 
 
 
303 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.27 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.9 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.74 
 
 
269 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.51 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.63 
 
 
265 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.19 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.04 
 
 
236 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.38 
 
 
232 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>