270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0434 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  81.61 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  70.22 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  69.78 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  64.71 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  54.02 
 
 		 233 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  50.68 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  49.56 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  42.86 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  53.39 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  46.75 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  42.92 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  38.68 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  38.91 
 
 		 240 aa  152  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  42.26 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  39 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  35.32 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  38.82 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  42.25 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  40.47 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  40.47 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  40.47 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  36.32 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  32.08 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.31 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  35.5 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  36.28 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.88 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  39.47 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  31.03 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  29.1 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  30.6 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  35.35 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  28.08 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.82 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  29.88 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  36.44 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  44.94 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  44.94 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  31.51 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  31.65 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  40.65 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  36.04 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  29.46 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  31.02 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  31.17 
 
 		 240 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  28.88 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  34.39 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  34.39 
 
 		 235 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  30.58 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  34.25 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  33.65 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  33.65 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  33.65 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  28.21 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  30.8 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  36.24 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  30.13 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  30.63 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  32.08 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  31.39 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  36.04 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  31.41 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  33.18 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  30.73 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  38.25 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  30.73 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  36.32 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  32.07 
 
 		 229 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  33.18 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  36.76 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  29.87 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  36.6 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  35.96 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  30.51 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  29.82 
 
 		 230 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.33 
 
 		 233 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  35.47 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.6 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  28.78 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  26.77 
 
 		 238 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  26.77 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  30.28 
 
 		 233 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  27.68 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  36.73 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  29.66 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  27.27 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  30.04 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  30.04 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  29.61 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  29.18 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  30.04 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  32.07 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  29.66 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  31.11 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.81 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.6 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  28.02 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  31.92 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  27.41 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>