More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0433 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  100 
 
 
232 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  74.46 
 
 
245 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  66.38 
 
 
240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  66.38 
 
 
240 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  65.95 
 
 
240 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  65.95 
 
 
240 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  65.95 
 
 
239 aa  297  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  67.83 
 
 
234 aa  297  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  66.96 
 
 
230 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  64.22 
 
 
242 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  65.09 
 
 
239 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  67.71 
 
 
241 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  62.66 
 
 
241 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  63.2 
 
 
232 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  64.66 
 
 
239 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  63.36 
 
 
239 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  63.36 
 
 
231 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  63.36 
 
 
239 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  63.36 
 
 
239 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  63.36 
 
 
239 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  63.36 
 
 
239 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  62.93 
 
 
239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  64.66 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  53.48 
 
 
243 aa  221  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  52.16 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  46.72 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  51.29 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  48.71 
 
 
234 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  50.87 
 
 
228 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  49.35 
 
 
221 aa  204  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  44.16 
 
 
236 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  50 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  50.43 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  49.57 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  47.41 
 
 
225 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  47.41 
 
 
225 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  50 
 
 
222 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  46.98 
 
 
223 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  47.03 
 
 
225 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  44.4 
 
 
250 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  46.98 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  45.65 
 
 
232 aa  187  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  46.55 
 
 
225 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 
223 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  49.35 
 
 
232 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  47.64 
 
 
232 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  46.03 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  46.52 
 
 
224 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  45.9 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  46.96 
 
 
224 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  48.28 
 
 
222 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  46.05 
 
 
223 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  46.12 
 
 
232 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  42.68 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  45.45 
 
 
223 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  44.93 
 
 
222 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  44.58 
 
 
226 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 
240 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  45.89 
 
 
229 aa  176  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  45.98 
 
 
223 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  43.9 
 
 
240 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  44.86 
 
 
236 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 
222 aa  175  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  45.54 
 
 
223 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  45.06 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  46.55 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  46.96 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  46.93 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  43.5 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  44.59 
 
 
228 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  43.36 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  42.98 
 
 
274 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  44.58 
 
 
234 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  41.33 
 
 
220 aa  168  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  45.41 
 
 
229 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  45.41 
 
 
229 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  43.64 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  44.08 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  38.6 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  38.89 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 
246 aa  158  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  41.2 
 
 
272 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  42 
 
 
271 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  42 
 
 
271 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  42.58 
 
 
263 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  37.66 
 
 
219 aa  150  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.66 
 
 
219 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  41.38 
 
 
230 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  40.65 
 
 
236 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  41.39 
 
 
272 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  36.96 
 
 
220 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  39.92 
 
 
247 aa  138  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  36.52 
 
 
220 aa  138  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  47.06 
 
 
230 aa  112  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  46.22 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
243 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  44.74 
 
 
227 aa  102  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
237 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>