164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0406 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  93.59 
 
 		 344 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  100 
 
 		 344 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  82.16 
 
 		 344 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  81.92 
 
 		 344 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  81.63 
 
 		 344 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  78.89 
 
 		 354 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  78.89 
 
 		 354 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  79.47 
 
 		 354 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  76.97 
 
 		 353 aa  547  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  78.89 
 
 		 364 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  78.89 
 
 		 354 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  78.89 
 
 		 364 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  76.38 
 
 		 353 aa  544  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  78.4 
 
 		 348 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  76.61 
 
 		 344 aa  535  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  76.68 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  76.68 
 
 		 378 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  76.38 
 
 		 352 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  76.68 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  76.68 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  76.38 
 
 		 352 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  76.68 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  76.68 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  76.25 
 
 		 364 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  75.95 
 
 		 354 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  74.19 
 
 		 366 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  75.44 
 
 		 355 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  75.15 
 
 		 355 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  74.19 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  74.56 
 
 		 343 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  72.27 
 
 		 359 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  72.46 
 
 		 350 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  72.46 
 
 		 347 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  69.65 
 
 		 347 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  67.25 
 
 		 348 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  68.24 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  66.37 
 
 		 348 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  65.88 
 
 		 347 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  67.54 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  66.96 
 
 		 348 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  69.03 
 
 		 347 aa  474  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  66.96 
 
 		 348 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  66.37 
 
 		 348 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  66.37 
 
 		 347 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  65.69 
 
 		 345 aa  471  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  69.59 
 
 		 345 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  66.28 
 
 		 345 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  66.08 
 
 		 348 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  67.06 
 
 		 345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  65.79 
 
 		 348 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  65.5 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  65.5 
 
 		 344 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  67.35 
 
 		 343 aa  465  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  68.33 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  65.7 
 
 		 352 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  64.33 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  63.34 
 
 		 359 aa  455  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  65.1 
 
 		 343 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  64.33 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  62.13 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  62.13 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  62.13 
 
 		 347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  63.61 
 
 		 342 aa  447  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  61.83 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  64.62 
 
 		 347 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  60.82 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  64.6 
 
 		 342 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  62.35 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  62.13 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  62.61 
 
 		 350 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  61.95 
 
 		 344 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  65.09 
 
 		 345 aa  437  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  61.83 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  62.13 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  62.13 
 
 		 343 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  62.17 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  59.05 
 
 		 342 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  59.71 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  60.36 
 
 		 342 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  57.6 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  66.77 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  59.47 
 
 		 342 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  60.18 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  59.88 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  58.94 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  61.81 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  56.47 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  58.41 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  58.41 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  56.76 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  57.23 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  60.82 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  57.06 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  59.65 
 
 		 346 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  58.89 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  57.23 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  56.07 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  59.24 
 
 		 348 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  59.65 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  58.77 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>