216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0356 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  87.54 
 
 		 624 aa  1102    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  75.7 
 
 		 618 aa  950    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  55.25 
 
 		 599 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 620 aa  1286    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  66.39 
 
 		 593 aa  818    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  55.76 
 
 		 589 aa  679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  74.37 
 
 		 657 aa  940    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  76.61 
 
 		 606 aa  976    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  74.03 
 
 		 606 aa  937    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  67.79 
 
 		 598 aa  831    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  74.87 
 
 		 640 aa  957    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  74.2 
 
 		 606 aa  940    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  60.07 
 
 		 603 aa  741    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  53.39 
 
 		 595 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  52.54 
 
 		 595 aa  629  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  51.95 
 
 		 596 aa  628  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  51.78 
 
 		 598 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  55.1 
 
 		 593 aa  628  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  52.02 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  51.96 
 
 		 592 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  51.19 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  51.35 
 
 		 598 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  48.9 
 
 		 597 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  48.98 
 
 		 597 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  39.66 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  37.96 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  38.15 
 
 		 593 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  37.19 
 
 		 599 aa  336  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  37.4 
 
 		 613 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  35.11 
 
 		 612 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  33.95 
 
 		 625 aa  319  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  35.11 
 
 		 613 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  34.44 
 
 		 611 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  34.4 
 
 		 619 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  35.81 
 
 		 612 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  36.53 
 
 		 609 aa  309  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  36.58 
 
 		 609 aa  309  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  36.41 
 
 		 609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  36.41 
 
 		 609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  33.89 
 
 		 627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.01 
 
 		 596 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  36.24 
 
 		 609 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  35.25 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  35.41 
 
 		 611 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  35.41 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  35.19 
 
 		 594 aa  303  7.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.63 
 
 		 586 aa  302  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  34.67 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 		 599 aa  300  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  35.14 
 
 		 602 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  35.14 
 
 		 602 aa  297  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  33.72 
 
 		 596 aa  296  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  35.06 
 
 		 617 aa  296  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  33.61 
 
 		 602 aa  296  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  34.78 
 
 		 616 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  33.67 
 
 		 608 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  33.61 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  33.55 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  34.56 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  31.82 
 
 		 594 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  35.02 
 
 		 624 aa  294  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  35.35 
 
 		 601 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  33.9 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  32.47 
 
 		 623 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  34.19 
 
 		 629 aa  291  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  34.21 
 
 		 850 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  32.9 
 
 		 623 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  32.28 
 
 		 617 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  34 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  32.79 
 
 		 605 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  34.57 
 
 		 610 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  34.24 
 
 		 600 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  34.49 
 
 		 611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.24 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 605 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  35.01 
 
 		 628 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  32.95 
 
 		 619 aa  286  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  33.45 
 
 		 598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  33.05 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  33.49 
 
 		 665 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  32.71 
 
 		 602 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  32.36 
 
 		 609 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  33.5 
 
 		 595 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  33.01 
 
 		 612 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  34.29 
 
 		 626 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33.84 
 
 		 600 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  32 
 
 		 598 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 		 593 aa  280  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  32.5 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  33.11 
 
 		 619 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  32.94 
 
 		 601 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 		 603 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  33.17 
 
 		 620 aa  277  5e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  34.29 
 
 		 626 aa  277  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>