173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0312 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0312  Na/Pi cotransporter II-related  100 
 
 
558 aa  1108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0365  Na/Pi cotransporter II-related  88.83 
 
 
563 aa  983  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4205  Na+/phosphate symporter  57.61 
 
 
565 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6270  hypothetical protein  55.28 
 
 
582 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0218  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  54.25 
 
 
562 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720634  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72230  hypothetical protein  55.47 
 
 
582 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.785925  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0069  Na+/Pi-cotransporter:Na/Pi cotransporter II-related  55.51 
 
 
550 aa  562  1e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0034  Na/Pi cotransporter II-like  55.53 
 
 
552 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148674  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0161  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  53.95 
 
 
552 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5082  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  54.14 
 
 
552 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0387022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3231  Na/Pi-cotransporter II-related protein  52.83 
 
 
552 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0145  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  53.76 
 
 
552 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.610668  normal  0.131446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4483  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  52.47 
 
 
549 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844603  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0511  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  56.42 
 
 
561 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.791872  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0163  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  53.38 
 
 
552 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5386  Na/Pi-cotransporter II-related protein  51.85 
 
 
577 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.626198  normal  0.600286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0118  Na/Pi cotransporter family protein  54.6 
 
 
550 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4443  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  53.28 
 
 
546 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2737  Na/Pi-cotransporter II-related protein  51.4 
 
 
556 aa  525  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3948  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  51.88 
 
 
548 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00173095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3770  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  52.07 
 
 
548 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3461  Na/Pi-cotransporter II-related protein  50.46 
 
 
576 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.677583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3401  Na/Pi-cotransporter II-related protein  51.03 
 
 
556 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1260  Na/Pi-cotransporter II-related protein  53.21 
 
 
553 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3851  Na/Pi cotransporter II-related  52.63 
 
 
553 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0461  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  51.69 
 
 
548 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1104  Na/Pi-cotransporter II-related protein  51.13 
 
 
559 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4010  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  50.19 
 
 
543 aa  492  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0189192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03892  predicted transporter  50.19 
 
 
543 aa  492  1e-138  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4256  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  50.19 
 
 
543 aa  492  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4564  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  50.19 
 
 
543 aa  492  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0371  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  50.82 
 
 
548 aa  493  1e-138  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3977  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  50.19 
 
 
543 aa  492  1e-138  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1430  Na/Pi cotransporter II-related  50.09 
 
 
548 aa  494  1e-138  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4514  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  50.09 
 
 
543 aa  492  1e-138  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03852  hypothetical protein  50.19 
 
 
543 aa  492  1e-138  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4473  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  50.19 
 
 
543 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5490  inorganic phosphate transporter, sodium-dependent  50 
 
 
543 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4601  sodium-dependent inorganic phosphate  50 
 
 
543 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4441  sodium-dependent inorganic phosphate  50 
 
 
543 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4402  sodium-dependent inorganic phosphate  50 
 
 
543 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433029  normal  0.437823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4524  sodium-dependent inorganic phosphate  50 
 
 
543 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0767506  normal  0.405258 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4527  sodium-dependent inorganic phosphate  50 
 
 
543 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0223  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  49.72 
 
 
543 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.344534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0751  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  47.13 
 
 
570 aa  460  1e-128  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0476826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01780  Na/Pi cotransporter II protein  49.64 
 
 
568 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2073  Na/Pi cotransporter II-related  43.28 
 
 
563 aa  432  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3921  putative Na+/phosphate transporter  41.32 
 
 
565 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146511  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0455  Na/Pi-cotransporter II-related protein  40.69 
 
 
565 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1406  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.75 
 
 
548 aa  360  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677902  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9037  hypothetical protein  39.42 
 
 
561 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4758  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.67 
 
 
601 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554336  normal  0.516218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1792  Na/Pi-cotransporter II-related protein  39.3 
 
 
553 aa  345  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3965  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.89 
 
 
547 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162548  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1481  Na/Pi-cotransporter family protein  36.23 
 
 
558 aa  336  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1685  Na+ cotransporter  35.99 
 
 
560 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1437  Na/Pi-cotransporter family protein  35.69 
 
 
558 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4223  Na/Pi-cotransporter II-related protein  38.39 
 
 
562 aa  329  1e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1871  Na/Pi cotransporter II-related  35.74 
 
 
548 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.860374  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2784  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  38.39 
 
 
548 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.407322 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4873  Na+cotransporter  34.06 
 
 
557 aa  317  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00339774  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3048  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  37.82 
 
 
548 aa  315  1e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7452  putative Na+/phosphate symporter  38.19 
 
 
578 aa  314  3e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0337065  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0141  Na+/Pi-cotransporter  33.58 
 
 
556 aa  311  3e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3286  hypothetical protein  39.32 
 
 
561 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.969266  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4023  Na+/Pi-cotransporter  39.11 
 
 
561 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3291  putative Na+/phosphate symporter  39.7 
 
 
564 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0855  Na+/Pi-cotransporter  32.38 
 
 
548 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63750  hypothetical protein  38.14 
 
 
555 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197236  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0816  sodium-dependent inorganic phosphate (Pi) transporter  35.27 
 
 
542 aa  260  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.568995  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5541  hypothetical protein  38.22 
 
 
555 aa  255  1e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0969  Na+/Pi-cotransporter family protein  31.08 
 
 
562 aa  255  1e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0614993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2745  Na/Pi-cotransporter II-related protein  29.64 
 
 
567 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0272264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1817  Na/Pi cotransporter II-related  30.68 
 
 
535 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1378  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.57 
 
 
556 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.90084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0990  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.4 
 
 
566 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.11336e-08  hitchhiker  0.000255335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1685  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.94 
 
 
563 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00916616  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1264  Na/Pi-cotransporter II-related protein  30.42 
 
 
558 aa  224  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2868  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.01 
 
 
536 aa  214  3e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.3552e-09  decreased coverage  7.84363e-14 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0220  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.49 
 
 
541 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.759835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0908  Na/Pi-cotransporter II-related protein  28.41 
 
 
541 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1692  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.84 
 
 
541 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2362  putative transporter  24.91 
 
 
537 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000947639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1525  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.76 
 
 
541 aa  204  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2677  Na/Pi-cotransporter family protein/PhoU family protein  24.34 
 
 
537 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.227034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2381  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.12 
 
 
643 aa  198  2e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0850551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0840  Na/Pi-cotransporter family protein  24.54 
 
 
551 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0001183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1501  Na/Pi-cotransporter II-related protein  27.49 
 
 
539 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0696  sodium-dependent phosphate transporter  24.17 
 
 
551 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.23681e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0880  Na/Pi-cotransporter family protein  23.99 
 
 
551 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17253e-34 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2768  Na/Pi-cotransporter II-related protein  25.99 
 
 
554 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0560713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4496  Na/Pi-cotransporter family protein  23.99 
 
 
551 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.04541e-08  decreased coverage  5.21204e-15 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0748  Na/Pi-cotransporter family protein  23.8 
 
 
551 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000512565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0878  Na/Pi-cotransporter family protein  23.99 
 
 
544 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.42556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0785  Na/Pi-cotransporter family protein  23.8 
 
 
551 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.37184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0948  Na/Pi-cotransporter family protein  23.99 
 
 
551 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.88119e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0683  sodium-dependent phosphate transporter  23.99 
 
 
551 aa  185  2e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  2.53455e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0057  Na/Pi-cotransporter II-related protein  26.2 
 
 
549 aa  183  8e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0512585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0649  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.93 
 
 
551 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  1.07719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0696  Na/Pi-cotransporter II-related protein  23.8 
 
 
551 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  3.10197e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>