197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0269 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
367 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  83.65 
 
 
367 aa  601  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  74.29 
 
 
363 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  74.01 
 
 
363 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  73.16 
 
 
363 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  64.31 
 
 
369 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  63.11 
 
 
369 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  62.26 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  62.53 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  63.36 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  63.09 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  63.36 
 
 
370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  63.36 
 
 
370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  62.26 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  62.26 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  62.53 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  62.26 
 
 
369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  62.26 
 
 
369 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  62.81 
 
 
369 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  63.36 
 
 
370 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  62.91 
 
 
369 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  62.5 
 
 
370 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  63.09 
 
 
370 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  50.84 
 
 
376 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  51.55 
 
 
373 aa  323  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  49.87 
 
 
396 aa  315  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  49.87 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  49.31 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 
383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  50.66 
 
 
391 aa  298  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  49.44 
 
 
404 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  47.47 
 
 
411 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1688  cytochrome oxidase assembly  52.12 
 
 
398 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  47.68 
 
 
407 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4383  cytochrome oxidase assembly  46.9 
 
 
406 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  49.84 
 
 
327 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4065  cytochrome oxidase assembly  48.97 
 
 
506 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.328508  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  44.02 
 
 
348 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  43.16 
 
 
325 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  38.92 
 
 
328 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  37.5 
 
 
339 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  40.56 
 
 
359 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  38.11 
 
 
335 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  38.11 
 
 
335 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  39.38 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  35.14 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  38.32 
 
 
325 aa  199  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  44.16 
 
 
339 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  35.03 
 
 
394 aa  195  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  39.5 
 
 
327 aa  195  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  36.1 
 
 
339 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  43.23 
 
 
359 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0129  cytochrome oxidase assembly  43.56 
 
 
357 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.96534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  42.9 
 
 
359 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4005  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 
327 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0069  cytochrome oxidase assembly  40.74 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  34.95 
 
 
387 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  34.78 
 
 
353 aa  189  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  41.53 
 
 
359 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  43.93 
 
 
357 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  40 
 
 
330 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  33.78 
 
 
387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  33.51 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  43.93 
 
 
357 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  39.75 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  42.35 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  39.18 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
325 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
325 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3040  cytochrome oxidase assembly  43.19 
 
 
342 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00748587  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0148  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
325 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4318  cytochrome oxidase assembly  39.88 
 
 
325 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  40.53 
 
 
361 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3523  cytochrome oxidase assembly  39.94 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3997  cytochrome oxidase assembly  37.32 
 
 
352 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00950  Cytochrome oxidase assembly protein  43.08 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  39.74 
 
 
356 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3798  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
352 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3871  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
352 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04006  cytochrome oxidase assembly  33.82 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2711  cytochrome oxidase assembly  35.01 
 
 
375 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318505  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  32.53 
 
 
671 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
313 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  36.73 
 
 
313 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  34.12 
 
 
333 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  35 
 
 
304 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  35.2 
 
 
307 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  33.18 
 
 
311 aa  96.3  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  32 
 
 
311 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  26.24 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  27.38 
 
 
326 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1670  cytochrome oxidase assembly factor  28.24 
 
 
364 aa  86.3  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0624262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1210  cytochrome oxidase assembly  35.86 
 
 
336 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.294531  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  30.54 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  27.7 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  33.68 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  30.54 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2709  cytochrome oxidase assembly  31.7 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0393197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  29.34 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1160  cytochrome oxidase assembly  28.66 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>