53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0242 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0344  hypothetical protein  89.56 
 
 		 431 aa  782    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1403  glutamate--cysteine ligase  73.95 
 
 		 429 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0173  putative glutamate--cysteine ligase  71.79 
 
 		 431 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0470  glutamate--cysteine ligase  74.19 
 
 		 429 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211009  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0189  glutamate--cysteine ligase  73.95 
 
 		 429 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0489  glutamate--cysteine ligase  74.19 
 
 		 429 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2830  glutamate--cysteine ligase  73.95 
 
 		 429 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1955  glutamate--cysteine ligase  82.94 
 
 		 432 aa  731    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2864  glutamate--cysteine ligase  74.42 
 
 		 429 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00201852  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2919  glutamate--cysteine ligase  74.42 
 
 		 429 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2250  glutamate--cysteine ligase GshA  74.42 
 
 		 429 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0242  glutamate--cysteine ligase GshA  100 
 
 		 431 aa  883    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4188  putative glutamate-cysteine ligase  77.21 
 
 		 429 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0439  glutamate--cysteine ligase  74.42 
 
 		 429 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2875  glutamate--cysteine ligase  74.42 
 
 		 429 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  0.177007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1660  glutamate--cysteine ligase  82.24 
 
 		 432 aa  715    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.851286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0409  glutamate--cysteine ligase  73.95 
 
 		 429 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2781  glutamate--cysteine ligase  74.42 
 
 		 429 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0258  glutamate--cysteine ligase  75.58 
 
 		 429 aa  693    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6193  glutamate--cysteine ligase GshA  74.42 
 
 		 429 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0654  glutamate--cysteine ligase  74.19 
 
 		 429 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0527  glutamate/cysteine ligase  76.98 
 
 		 429 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0200  glutamate/cysteine ligase  89.79 
 
 		 431 aa  788    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.770755  normal  0.19114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0293  glutamate--cysteine ligase GshA  97.45 
 
 		 431 aa  862    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0219  glutamate/cysteine ligase  90.02 
 
 		 431 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000276666 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3215  hypothetical protein  73.95 
 
 		 429 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4583  glutamate--cysteine ligase GshA  70.4 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3940  glutamate--cysteine ligase  69.93 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0011  glutamate--cysteine ligase GshA  70.07 
 
 		 428 aa  623  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0602184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3259  glutamate/cysteine ligase  69.39 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0191292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3910  glutamate--cysteine ligase  69.39 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195773  normal  0.80234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3750  glutamate--cysteine ligase  67.37 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4542  glutamate--cysteine ligase  67.52 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.907644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5997  glutamate--cysteine ligase  66.9 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0724112  hitchhiker  0.00190947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2516  glutamate--cysteine ligase GshA  67.37 
 
 		 431 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2408  glutamate--cysteine ligase GshA  67.06 
 
 		 426 aa  594  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0573  glutamate/cysteine ligase  67.29 
 
 		 437 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0216  glutamate--cysteine ligase GshA  65.26 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0763  glutamate--cysteine ligase GshA  62.85 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0426  glutamate/cysteine ligase  62.21 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1252  glutamate--cysteine ligase  62.47 
 
 		 429 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1824  glutamate--cysteine ligase GshA  56.34 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0105  glutamate--cysteine ligase  52.97 
 
 		 435 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.005063  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2076  glutamate--cysteine ligase  52.97 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000044914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1811  hypothetical protein  55.85 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1812  hypothetical protein  55.5 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2671  glutamate/cysteine ligase  53.55 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.630756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3064  glutamate--cysteine ligase  53.55 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0913039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0513  glutamate/cysteine ligase  50.36 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0125  glutamate--cysteine ligase  35.34 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1188  glutamate--cysteine ligase-related protein  34.48 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0076  glutamate-cysteine ligase-related protein  37.47 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0308  glutamate--cysteine ligase  35.21 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>