More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0233 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  82.12 
 
 		 178 aa  289  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  66.67 
 
 		 213 aa  258  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  62.98 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  66.27 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  65.87 
 
 		 174 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  72.79 
 
 		 176 aa  227  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  73.47 
 
 		 176 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  73.15 
 
 		 194 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  73.2 
 
 		 178 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  73.2 
 
 		 178 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  73.33 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  73.33 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  73.33 
 
 		 178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  71.9 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  70.47 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  69.8 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  60.87 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  60.43 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  59.26 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  61.76 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  58.82 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  55.56 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  58.09 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  58.09 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  57.35 
 
 		 164 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  47.88 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  49.33 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.26 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  45.27 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.58 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  37.69 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  32.73 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  33.55 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  33.9 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  40.65 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.3 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  37.33 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.3 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  38.57 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.68 
 
 		 173 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  29.22 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  35.42 
 
 		 173 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  39.37 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.33 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 173 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  34.72 
 
 		 173 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  35.71 
 
 		 170 aa  88.2  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.56 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.9 
 
 		 173 aa  87.8  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  34.03 
 
 		 173 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 		 169 aa  87.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 		 169 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.62 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  27.78 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  28.65 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.07 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  30.83 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  30.43 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  36.07 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.71 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  34.68 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.01 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  30.37 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.95 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  35.43 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  31.33 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.4 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  25.95 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  31.58 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.46 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.82 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.95 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  32.81 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  32.81 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  32.81 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.6 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  32.81 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  32.81 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.93 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.94 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  30 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.14 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  31.65 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  31.65 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  37.8 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  30.91 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  30.19 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  31.65 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>