More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0206 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2536  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  73.39 
 
 		 504 aa  728    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  87.32 
 
 		 499 aa  855    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.57 
 
 		 496 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.8 
 
 		 502 aa  721    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3497  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  75.51 
 
 		 500 aa  755    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.412544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  70.24 
 
 		 506 aa  732    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.99 
 
 		 504 aa  665    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.98 
 
 		 496 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.23 
 
 		 507 aa  860    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.89 
 
 		 511 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2931  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 508 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.15 
 
 		 512 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.63 
 
 		 505 aa  739    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.77 
 
 		 496 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  75.91 
 
 		 500 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4070  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 508 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.01 
 
 		 496 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  92.48 
 
 		 505 aa  941    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1611  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 508 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  71.77 
 
 		 535 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3917  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  81.17 
 
 		 512 aa  813    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0202  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 508 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.87 
 
 		 499 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4576  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.98 
 
 		 506 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3996  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.28 
 
 		 508 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1883  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.38 
 
 		 506 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0709118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 		 496 aa  659    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.98 
 
 		 506 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 		 496 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3333  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 508 aa  818    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.52 
 
 		 499 aa  636    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.34 
 
 		 508 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.07 
 
 		 499 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4547  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  71.69 
 
 		 510 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0015  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  79.13 
 
 		 512 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.84 
 
 		 503 aa  737    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  79.53 
 
 		 507 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1035  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.1 
 
 		 506 aa  740    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 499 aa  651    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50080  malonate/methylmalonate semialdehyde dehydrogenase  78.34 
 
 		 499 aa  765    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  86.23 
 
 		 507 aa  860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 505 aa  1029    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4812  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.72 
 
 		 506 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.98 
 
 		 506 aa  747    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.97 
 
 		 496 aa  661    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5671  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  71.43 
 
 		 505 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.38 
 
 		 506 aa  745    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.32 
 
 		 509 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  76.01 
 
 		 506 aa  763    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.07 
 
 		 497 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  63.38 
 
 		 496 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  63.01 
 
 		 496 aa  646    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2990  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 540 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.6 
 
 		 496 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.73 
 
 		 499 aa  639    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.64 
 
 		 499 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4249  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  68.88 
 
 		 501 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.38 
 
 		 506 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.32 
 
 		 501 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  70.14 
 
 		 522 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 		 497 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.37 
 
 		 496 aa  663    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5814  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  79.33 
 
 		 507 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.82 
 
 		 497 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.98 
 
 		 506 aa  747    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.15 
 
 		 496 aa  651    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  80.48 
 
 		 540 aa  810    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.46 
 
 		 508 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.46 
 
 		 508 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.66 
 
 		 509 aa  634  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.26 
 
 		 508 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 497 aa  630  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.32 
 
 		 506 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.1 
 
 		 498 aa  629  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.66 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.09 
 
 		 497 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.66 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.66 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.66 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.48 
 
 		 498 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  61.46 
 
 		 497 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.24 
 
 		 502 aa  623  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.69 
 
 		 497 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4044  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.92 
 
 		 498 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6743  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  62.83 
 
 		 498 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1446  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 507 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.6 
 
 		 501 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000699732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0386  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.27 
 
 		 498 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.433719  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0419  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.06 
 
 		 498 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214339  hitchhiker  0.00208567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3662  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.63 
 
 		 496 aa  608  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3343  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  60.64 
 
 		 503 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0836  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.27 
 
 		 498 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0420  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  59.8 
 
 		 499 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4104  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.49 
 
 		 505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0652  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  58.95 
 
 		 502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.18 
 
 		 498 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.78 
 
 		 498 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  60.24 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  61.69 
 
 		 499 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0780531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0372  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.6 
 
 		 501 aa  600  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>