122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0141 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 		 334 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  80.07 
 
 		 322 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.42 
 
 		 281 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.76 
 
 		 285 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  56.12 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.92 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  53.88 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.88 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.91 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  47.41 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.91 
 
 		 263 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  52.43 
 
 		 263 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  53.17 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  53.17 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  53.17 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  52.91 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  52.91 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  53.17 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.4 
 
 		 263 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  52.2 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  53.4 
 
 		 263 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.4 
 
 		 252 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  45.79 
 
 		 212 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.52 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  49.47 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.19 
 
 		 216 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  43.2 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  42.08 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  36.41 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.02 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.02 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  36.56 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.33 
 
 		 248 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.67 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.87 
 
 		 243 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  37.5 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.37 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  33.72 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.14 
 
 		 240 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.64 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  39.76 
 
 		 215 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  32.97 
 
 		 229 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.16 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.47 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.22 
 
 		 215 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  35.84 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.2 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  35.26 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 220 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.12 
 
 		 232 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.77 
 
 		 240 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.29 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.53 
 
 		 234 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.52 
 
 		 237 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.93 
 
 		 235 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  34.94 
 
 		 233 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  34.34 
 
 		 236 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.22 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  33.92 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.79 
 
 		 220 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  30.23 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  32.53 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.35 
 
 		 222 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  38.03 
 
 		 250 aa  86.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  30.85 
 
 		 237 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.93 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.79 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.81 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.06 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  30.53 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  23.11 
 
 		 223 aa  57  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  32.96 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  24.38 
 
 		 202 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.89 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  30.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  28.9 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  25 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  31.49 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 238 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 227 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  27.47 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.89 
 
 		 1053 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.44 
 
 		 202 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 		 229 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25.19 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 212 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25 
 
 		 226 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>