More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0136 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 459 aa  915    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  69.91 
 
 		 451 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  52.91 
 
 		 448 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.42 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  51.4 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.68 
 
 		 436 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 436 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  45.35 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  45.12 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  44.88 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.7 
 
 		 476 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  46.45 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 467 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 450 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  34.41 
 
 		 422 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  34.84 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  34.11 
 
 		 414 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  30.51 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  29.37 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 479 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  30.75 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  29.06 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  29.3 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  34.83 
 
 		 442 aa  166  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  30.98 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  28.99 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 436 aa  153  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  28.32 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  28.2 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  30.98 
 
 		 442 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  29.3 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  29.57 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  29.93 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  28.92 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  27.82 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  28.14 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1843  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0601  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.82 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  29.17 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 436 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  26.59 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 420 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  25.5 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  25.97 
 
 		 463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.06 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  23.97 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  25.68 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>