55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0095 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  213  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  79.25 
 
 		 105 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  56.48 
 
 		 105 aa  116  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  55.14 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  55.14 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  52.78 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  51.85 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  50.93 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  50.89 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  53.27 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  50.89 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  51.35 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  51.35 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  51.35 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  46.23 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  44.34 
 
 		 106 aa  90.1  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  46.23 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  43.4 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  50.91 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  41.23 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  40.19 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  39.13 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  41.28 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  35.45 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  35.51 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  41.44 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  46.36 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  46.36 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  42.45 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  37.14 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  28.85 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  40.18 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000384  hypothetical protein  33.96 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  36.61 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  39.66 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0269  hypothetical protein  35.78 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2686  hypothetical protein  27.62 
 
 		 105 aa  50.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1187  hypothetical protein  32.38 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1227  hypothetical protein  29.81 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3956  hypothetical protein  30.77 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2558  hypothetical protein  26.67 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0077  hypothetical protein  34.62 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0010  hypothetical protein  35.58 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.409313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1401  Domain of unknown function DUF1840  27.88 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.563745  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1220  hypothetical protein  23.81 
 
 		 98 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>