95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0067 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  76.26 
 
 
216 aa  346  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  70.64 
 
 
215 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  70.18 
 
 
215 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  71.56 
 
 
215 aa  315  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  65.47 
 
 
219 aa  298  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  65.44 
 
 
222 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  63.3 
 
 
215 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.36 
 
 
214 aa  274  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.42 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.34 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.63 
 
 
215 aa  264  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  59.63 
 
 
215 aa  264  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.08 
 
 
214 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.99 
 
 
215 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.6 
 
 
215 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.6 
 
 
215 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.6 
 
 
215 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.6 
 
 
215 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.6 
 
 
215 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  56.22 
 
 
217 aa  257  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.6 
 
 
215 aa  257  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.34 
 
 
215 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.34 
 
 
215 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.34 
 
 
215 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.68 
 
 
215 aa  255  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.91 
 
 
215 aa  255  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.45 
 
 
215 aa  254  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.13 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.75 
 
 
222 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.34 
 
 
215 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.38 
 
 
215 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  55.05 
 
 
206 aa  234  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  55.25 
 
 
213 aa  224  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  51.33 
 
 
224 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.08 
 
 
217 aa  222  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.63 
 
 
212 aa  221  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  52.05 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.24 
 
 
215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.04 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.33 
 
 
212 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.26 
 
 
213 aa  204  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.33 
 
 
213 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.41 
 
 
212 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.57 
 
 
202 aa  198  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  46.8 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.52 
 
 
233 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.22 
 
 
203 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.84 
 
 
215 aa  187  8e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.73 
 
 
216 aa  186  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.84 
 
 
214 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.84 
 
 
215 aa  185  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.76 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  44.76 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.22 
 
 
226 aa  174  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.76 
 
 
211 aa  169  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.21 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.51 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  46.12 
 
 
209 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  37.96 
 
 
213 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.19 
 
 
205 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.8 
 
 
203 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.74 
 
 
222 aa  154  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  38.19 
 
 
201 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  43.89 
 
 
214 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.41 
 
 
200 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.06 
 
 
208 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  41.11 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  43.91 
 
 
223 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.23 
 
 
211 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  37.5 
 
 
232 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  40.83 
 
 
215 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  33.16 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  32.57 
 
 
211 aa  109  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  47.71 
 
 
146 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  30.84 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  34.09 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  35.42 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  29.06 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.68 
 
 
167 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.33 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  28.21 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  28.12 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.04 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1189  putative pyroglutamyl-peptidase  27.53 
 
 
174 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.389859  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.08 
 
 
200 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.18 
 
 
171 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.19 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.63 
 
 
171 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.8 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26.56 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  23.56 
 
 
216 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  24.47 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.23 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4016  hypothetical protein  23.76 
 
 
170 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>