58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0065 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0065  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0090  hypothetical protein  95.22 
 
 		 243 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2168  hypothetical protein  82.43 
 
 		 239 aa  390  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.202836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1971  protein of unknown function DUF969  85.09 
 
 		 241 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.988199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2371  protein of unknown function DUF969  83.12 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1601  normal  0.836703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0192  hypothetical protein  70.25 
 
 		 249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3744  protein of unknown function DUF969  70.2 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.79738  normal  0.788964 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1217  hypothetical protein  71.05 
 
 		 239 aa  321  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414254  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5731  hypothetical protein  71.55 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195243  normal  0.543565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0873  hypothetical protein  70.25 
 
 		 247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2906  hypothetical protein  71.43 
 
 		 254 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1258  hypothetical protein  69.14 
 
 		 243 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0785505  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1170  hypothetical protein  68.31 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000118885  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3592  hypothetical protein  68.31 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1118  hypothetical protein  68.31 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0005  hypothetical protein  69.47 
 
 		 261 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0227  hypothetical protein  72 
 
 		 247 aa  305  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0446  hypothetical protein  68.97 
 
 		 338 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2114  hypothetical protein  68.97 
 
 		 352 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3371  hypothetical protein  68.97 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0263  hypothetical protein  68.97 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0250  hypothetical protein  68.97 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2977  hypothetical protein  68.97 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.226934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3291  protein of unknown function DUF969  66.67 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6525  protein of unknown function DUF969  58.59 
 
 		 245 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0020  hypothetical protein  53.04 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00300122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1182  protein of unknown function DUF969  53.51 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2570  protein of unknown function DUF969  51.56 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2013  hypothetical protein  54.34 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319899  normal  0.403491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3452  hypothetical protein  53.54 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.159434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3959  hypothetical protein  53.54 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4532  hypothetical protein  53.54 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.754245 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4059  hypothetical protein  53.88 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3466  hypothetical protein  53.88 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4307  hypothetical protein  53.88 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0933  hypothetical protein  52.42 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1378  hypothetical protein  47.77 
 
 		 230 aa  205  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0577  hypothetical protein  47.32 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0656  hypothetical protein  47.32 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2871  hypothetical protein  43.23 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2846  permease  43.67 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3085  hypothetical protein  44.39 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.831392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3099  hypothetical protein  42.92 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3117  hypothetical protein  43.67 
 
 		 231 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000991009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3094  hypothetical protein  44.25 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2879  hypothetical protein  44.25 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.225033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2151  hypothetical protein  44.75 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3118  hypothetical protein  43.95 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2480  hypothetical protein  52.13 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2807  permease  44.39 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2881  protein of unknown function DUF969  54.36 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0437  protein of unknown function DUF969  42.44 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000406355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1372  hypothetical protein  42.18 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.157148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1680  hypothetical protein  38.21 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.936458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1415  hypothetical protein  37.74 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0773605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1834  hypothetical protein  38.33 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.320572 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0177  hypothetical protein  35.07 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000813125  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1237  protein of unknown function DUF969  29.47 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>