74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0047 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 356 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  65.83 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  50.47 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  50.48 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  49.84 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  35 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  37.65 
 
 		 275 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  36.3 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  36.86 
 
 		 275 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  34.41 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  33.56 
 
 		 272 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  34.87 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  33.59 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  33.19 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  33.75 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  35.43 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  30.2 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  25.3 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  33.16 
 
 		 729 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  33.89 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  33.75 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  27.73 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  27.31 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.21 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  28.3 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  32.47 
 
 		 741 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  29.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  25.65 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  24.82 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1173  dienelactone hydrolase  29.47 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  29.73 
 
 		 261 aa  53.1  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  30.87 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  26.29 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  27.22 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  27.75 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  27.22 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6411  hypothetical protein  27.96 
 
 		 680 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  27.22 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  25.52 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.76 
 
 		 641 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.11 
 
 		 751 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.72 
 
 		 653 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0791  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.72 
 
 		 653 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0839  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.72 
 
 		 651 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  28.69 
 
 		 253 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6412  hypothetical protein  28.28 
 
 		 730 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  28.28 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  27.47 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  28.33 
 
 		 242 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  28.29 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  29.35 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.52 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  28.57 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  28.57 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  27.23 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.81 
 
 		 628 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  29.86 
 
 		 236 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  28.52 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  23.78 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  25.47 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  25.43 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  23.3 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3058  carboxymethylenebutenolidase, putative  44.44 
 
 		 242 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3313  twin-arginine translocation pathway signal  25.2 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 		 646 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  24.32 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07760  dienelactone hydrolase-like enzyme  25.74 
 
 		 240 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25 
 
 		 242 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 242 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2606  hypothetical protein  27.91 
 
 		 279 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0027  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.29 
 
 		 642 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.018636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>